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Raúl de la Puente

el espacio web de @DoctorGenoma

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Vaya mierda de podcast

“Cinéfilo, melómano o lector compulsivo. Lo único que le importa es su estantería y como ampliarla”; “Degenerao amante de los videojuegos que va diciendo que sabe de informática pero lo máximo que sabe hacer es poner el título de este post en html básico básico básico” “Adicto a los videojuegos, le gusta el manga, el anime y el papercraft (o como lo suelen llamar; los recortables de papel)”. No, no me he vuelto tarumba y me he equivocado de sitio donde plasmar mis pensamientos. Son un extracto de las autobiografías de Carlos Cuba, Juanjo Gómez y Alejandro Ariza, respectivamente, que forman el staff de Vaya mierda de podcast. Llevan la friolera de 15 episodios desde comenzaron en enero de este año y siguen igual de frescos.

Es un podcast de humor (por si no se había notado) en el que mantienen conversaciones sobre temas como juegos de mesa, tiburones y viajes en el tiempo, curaciones milagrosas (con todo tipo de técnicas homeopáticas)…pero donde la improvisación termina mandando y pueden acabar de hablando de cosas inesperadas. Por cierto, tienen un episodio dedicado a cómo grabar un podcast. Meritorio. 
La periodicidad es quincenal (por lo menos lo intentan) y han expandido su desparpajo sureño (recordemos que hablo desde la zona norte española, no vayamos a confundir ok?) por gran parte de medios: Twitter, Facebook, Tuenti (en redes sociales) y la suscripción es sencilla mediante los clarísimos enlaces al feed, iTunes o iVoox. Eso sí, han pedido que nos tomemos cierta paciencia en la contestación de correos y demás…XDD.
Ale! ya tenéis más audios para rellenar huecos de aburrimiento.

Web de Vaya Mierda de Podcast

P.D.: Desde aquí os decimos que SÍ hemos navegado por vuestro blog. Currado, sí señores.

Una subida de archivos cualquiera a Dropbox

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Memoria epigenética

La epigenética es uno de los campos que me apasionan y que está cobrando importancia en los últimos años. En esta ocasión, el artículo que voy a comentar puede llegar a tener un tono Lamarquista. Pero eso confirma lo complejo del diseño de la expresión génica, no vayamos a confundir ;-P. Investigadores del Centro John Innes de Norwich, en el Reino Unido, han hecho un descubrimiento que explica cómo un organismo puede crear una memoria biológica de ciertas variables tales como la calidad de la nutrición o la temperatura.

El descubrimiento explica el mecanismo de esta memoria – una especie de interruptor biológico – y la forma en que también pueden ser heredadas por la descendencia. El trabajo fue dirigido por el doctores Martin Howard y Caroline Dean recibiendo financiación del Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC).
La doctora Dean comentó que: “Hay muchos ejemplos que ahora sabemos donde la actividad de los genes pueden ser afectados a largo plazo por factores ambientales. Y en algunos casos, el medio ambiente en el que habita un individuo en realidad puede afectar a la biología o la fisiología de sus hijos, pero sin alterar la secuencia del genoma”.
Por ejemplo, algunos estudios han demostrado que en las familias donde había una grave escasez de alimentos en la generación de los abuelos, los hijos y nietos tienen un mayor riesgo de enfermedad cardiovascular y diabetes, lo que podría explicarse por la memoria epigenética. Pero hasta ahora no ha habido un mecanismo claro para explicar cómo los individuos pueden desarrollar esa “memoria” de un factor variable, como la nutrición.
El equipo utilizó el ejemplo de cómo las plantas “recuerdan” la duración del período de invierno para que la polinización, el desarrollo, la dispersión de semillas y la germinación ocurra en el momento adecuado. Como casi siempre, Arabidopsis thaliana fue la especie vegetal elegida para indagar en este tema.
El doctor Howard advierte que: “Ya sabíamos mucho acerca de los genes implicados en la floración y estaba claro que algo pasa en el invierno que afecta al tiempo de floración, de acuerdo con la duración del período de frío”.
Usando una combinación de modelos matemáticos y el análisis experimental, el equipo de investigación ha descubierto el sistema por el cual un gen clave llamado FLC esté desactivado o activado en cualquiera de sus células y, también, en su progenie. Encontraron que cuanto mayor sea el período de frío, mayor es la proporción de células que poseen el gen FLC estable y desactivado. Esto provoca un retraso la floración y se debe a un fenómeno conocido como memoria epigenética.
La memoria epigenética proviene de concretas modificaciones y una de las más importantes ocurre en las histonas (las proteínas alrededor de los cuales el ADN se envuelve). Ciertas modificaciones químicas que están en las histonas pueden afectar a la expresión de los genes cercanos, activándolos o desactivándolos (Aclaración no imprescindible que sirve de repaso: la cromatina está conformada por una unidad básica, el nucleosoma, conformado por histonas (H2A, H2B, H3 y H4) unidas a proteínas no histónicas. En el nucleosoma se enrolla el ADN. Por modificaciones post-traduccionales se puede modificar la configuración de las histonas. Las histonas sufren modificaciones por medio de procesos de acetilación, fosforilación, metilación, desaminación, isomerización de prolinas y ubiquitinización. Combinaciones específicas en la modificación de las histonas sirven como una especie de código que determina si el gen ha de ser silenciado o expresado y esta es otra forma de cómo se puede dar la regulación génica). Estas modificaciones pueden ser heredadas por las células hijas, cuando las células se dividen, y si se producen en las células que forman los gametos (por ejemplo, espermatozoides en mamíferos o el polen en las plantas), entonces también puede pasar a la descendencia.
Basándose en que cada nucleosoma abarca aproximadamente 175bp y que la longitud del gen FLC es de aproximadamente 6000bp del gen el número de nucleosomas es de unos 35. Cada uno de estos nucleosomas tiene dos copias de cada uno de los las histonas H2A, H2B, H3 y H4. Las modificaciones de las histonas que se cree que son clave en la memoria epigenética de vernalización están en la cola de la histona H3. De todas formas, existen 70 sitios diferentes que son capaces de aceptar las modificaciones.

Tipos de cambios epigenéticos
Imagen en la que se muestran los dos principales modificaciones epigenéticas. (Imagen: Nature 441, 143-145 (11 May 2006)).
El modelo matemático predijo que dentro de cada célula individual, el gen FLC debe estar completamente activado o silenciado, siendo mayor la proporción de células que pueden cambiar al estado “silenciado” cuanto más tiempo de frío.
Para evidenciar este hecho, se utilizó una técnica mediante la cual cualquier célula que tuviera el gen FLC activado aparecía de color azul bajo un microscopio. Según ellos, a partir de estas observaciones estaba claro que las células se encontraban activadas o desactivadas (en relación al gen FLC) en su totalidad, de acuerdo con la teoría. También se mostró que las histonas cercanas al gen FLC se encontraban modificadas durante el período de frío.
Para los que no conocíais este mundo epigenético, podéis observar lo complejos que somos los seres vivos. Os animo a que leais los otros artículos sobre este tema que fueron publicados aquí anteriormente y también el artículo “recién sacado del horno” en el blog Locos por la biología.

Este post participa en la V Edición del Carnaval de Biología, Primera Edición del Biocarnaval de Verano, que organiza @Tiwnacu en su blog Marimaru’s blog y también en el VI Carnaval de Química organizado en el blog “Divagaciones de una investigadora en apuros”.
Logo del Carnaval de Biología

VI Carnaval de Química

Fuente: BBSRC
Referencia: A Polycomb-based switch underlying quantitative epigenetic memory. Andrew Angel, Jie Song, Caroline Dean, Martin Howard. Nature (2011) vol. advance online publication http://dx.doi.org/10.1038/nature10241

All about Android

La sequía en cuanto a emisión de podcast sobre Android en español, está provocando que siga escuchando y viendo programas venidos del otro lado del charco. All about Android es un videopodcast (que también tiene su versión de sólo audio) típico de la factoría Leo Laporte en sus programas TWIT (que si no me fallan la cuentas, cuenta con unos 34 “shows”): Se tiene su versión en audio pero que, al mismo tiempo, está siendo grabada en video para que se pueda seguir el programa como si se estuviera en el estudio de grabación. Cuando comencé a ver esos programas, me recordaban a los documentales o anuncios en los que salían los locutores y saludaban detrás de la mampara a la zona de edición. Es una perspectiva muy buena para poder observar lo que se hace dentro de un estudio profesional. Y muestra los tremendos medios que utilizan en sus programas.
Volviendo al programa sobre Android, lo presentan 3 podcasters: Jason Howell, Eileen Rivera y Ron Richards, donde este último graba vía Skype (o similar) desde su casa. Comentan las noticias relacionadas con el sistema operativo móvil de Google, intercambian impresiones con invitados al programa y muestran aplicaciones que les han llamado la atención. Estas demostraciones hacen que gane puntos suscribirse a la versión con vídeo, ya que pueden verse en acción dichas aplicaciones y ver cómo funcionan realmente en los dispositivos (los cuáles suelen ser de lo último, claro).
Recomiendo éste y cualquiera de los programas TWIT porque, aunque sean en inglés, es todo muy técnico y bien pronunciado (nada de hablar entre dientes, aunque a veces se aceleren). Esperemos que la buen labor de Google esforzándose en la adición de subtítulos en los canales de Youtube (por medio de los cuales también se pueden seguir todos los programas TWIT), haga más accesible a los no familiarizados con el idioma anglosajón la comprensión de este gran podcast. Por ahora sólo se lo puedo recomendar a los que tengan el inglés más o menos afianzado.
Os dejo incrustado el vídeo del último programa para que podáis echar un vistazo. A ver si se animan a grabar estos podcasters “Androides” por estos lares…;-P

Web de All about Android

TECNO: “El instinto tecnológico” con @doctorGENoma

doctorGENoma en TECNO
Durante estos últimos meses me veo inmerso en finalizar mi Tesis doctoral. Como muchos sabréis, el podcasting forma gran parte de mi día a día. Pues, hace un tiempo, tuve el honor de ser entrevistado por Sebas Oliva para su podcast Tecno. Y digo honor porque es todo un privilegio encontrarse en un programa en el que han participado gente como América Valenzuela, Juande Santander, Sonia Blanco, Isabel Iglesias, David Serantes..etc. por decir los más sonados a nivel nacional (que no me olvido de otros conocidos como SXenia, Joaquín García, Dani Aragay, Óscar J. Baeza, José María Ortiz, Ramón Rey, Roberto Tomás y el Profesor Bacterio).
Como ya comenté en un anterior post, este podcast está dedicado a conversar sobre el entorno tecnlógico en el que viven los entrevistados. En mi caso, damos un repaso a mis inicios en la tecnología y mi evolución en la misma. Así también comentamos las dos webs en las que estoy inmerso (cuando el tiempo me lo permite): rauldelapuente.com/ y lapodcastfera.net. Los que ya me conocen, no les va a extrañar nada de lo que oigan. Al resto, os animo a que nos escuchéis. Creo que no os aburriréis demasiado. Y no olvidéis de comentar (en cualquier sitio; Facebook, Twitter, Google plus, comentarios en los respectivos blogs, correo electrónico…como queráis) qué os ha parecido.

Escuchando: ummmh!¿Qué creéis? ;-P

Microentradas: "El instinto tecnológico" en TECNO

Esta vez vamos a “barrer un poco para casa”. He sido entrevistado en el podcast dedicado a la tecnología que nos rodea de Sebas Oliva: TECNO. Y debía publicarlo en esta web…digo yo, ¿no?.
En este programa tratamos la evolución que he tenido en el ámbito tecnológico, tanto dentro como fuera del campo científico.
Ha sido para mí todo un privilegio formar parte del podcast y os animo a que lo descubráis. Más aún a los insensatos que no lo tengáis en vuestros feed ;-P.
Por último…¿Tenéis instinto tecnológico?

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