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Adenosina: ¿un nuevo descubrimiento?

Estoy más que harto que no hagan más que decir chorradas en la televisión relacionada con ciencia. Ya lleva más de un año en la parrilla publicitaria, pero no he tenido la oportunidad de escribir sobre el nuevo descubrimiento de Shiseido: la adenosina. Hay que tocarse las narices. Ahora van y dicen que han descubierto un nuevo compuesto llamado Adenosina. ¿Es que no hay ningún comité científico que evalúe las mentiras que se pueden llegar a decir por la televisión? A ver si ahora va a ser mentira lo que estudié en primero de carrera sobre el ribonucleósido llamado adenosina, imprescindible para formarse el Adenosin trifosfato (ATP) que es la molécula principal de generación de energía. Yo alucino cada día más.
Deberían hacer más hincapié en hacer un seguimiento sobre la malainformación y dejarse de cobrar tantos canones por la propiedad intelectual. ¿Acaso no es propiedad intelectual de TODOS que lo que se diga en los medios sea VERDADERO y no MALINFORMACIÓN?

EScuchando: Como se calienta el procesador, igual que yo.

MAPMAKER/EXP 3.0

Este programita generado por Lander y colaboradores en 1987, es uno de los más utilizados (si no es el que más). Es un software basado en MS-DOS que se basa en cálculos matemáticos para generar mapas genéticos. Simplemente la función que realiza es ordenar mediante cálculos de frecuencias alélicas, los marcadores (porciones de ADN que pueden ser o no genes) para formar los distintos grupos de ligamiento (que posteriormente podremos asignarles cromosomas). Estas operaciones serían casi imposibles por el tiempo que llevarían hacerlas a mano. Tan sólo hay un método que puede (y digo puede) ser más sencillo y realizarse a mano: el Color Mapping o mapeo por color. Pero eso será otro cantar.
Intentaré hacer un tutorial sobre la utilización del programa. Lo que sí quería destacar son las peculiaridades del programita. Al ser un MS-DOS (por lo tanto hablamos de estar trabajando en Windows), el acceso y ejecución de órdenes tiene que ser por teclado. Lo primero de todo es el formato del archivo y su ubicación. Todo tiene que estar dentro del mismo directorio que el ejecutable. Y el archivo para trabajar tiene que estar en formato .RAW. Ese archivo es un simple archivo de texto cuya extensión de cambia a .raw. Para generar un archivo con la matriz de datos recopilados, tan sólo hay que copiar de excel todas las celdas y pegar en el bloc de notas. El encabezado de los datos del archivo tiene que tener una nomenclatura y orden preciso. Es necesario porque si no el programa dará error a la hora de leer el archivo. Ese encabezado debe estar en la parte superior del archivo y tiene esta pinta:

data type f2 intercross
113 174 0

donde se observa que los tipos de datos son una población F2 y que hay 113 individuos en los que se analizan 174 marcadores.
Estas son las nociones básicas para poder arrancar el programa y los datos que se han obtenido en la experimentación. Espero que haya servido de algo.

Yoga contra el estrés laboral

Veinte minutos diarios de yoga y meditación en el lugar de trabajo, combinados con seis sesiones semanales en grupo, pueden aliviar la sensación de estrés en más de un 10 por ciento, y mejorar la calidad del sueño de los sedentarios empleados de oficina, sugiere un estudio piloto.
“Se asocia el estrés crónico con las enfermedades crónicas. Por eso, me centro en cómo reducir el estrés antes de que se convierta en causa de enfermedad”, explica Maryanna Klatt, autora principal del estudio y profesora de la Universidad Estatal de Ohio. “Mi interés es comprobar si la gente llega a reducir su uso de asistencia médica al reducir su estrés. Pretendo desarrollar algo que cueste poco y sea aplicable en el propio lugar de trabajo, algo práctico y que pueda hacerse con regularidad”.
De todas formas el estudio fue algo irreal. Cada día se dedicaba 20 minutos para el yoga y luego se hacían además 6 sesiones semanales de 1 hora en grupo. Todos sabemos que esto no es posible. Por lo menos en este país, donde prima mucho más un café que el bienestar personal.

Escuchando: Michael Jackson – Beat it

Papers

Esta es una aplicación dirigida a admnistrar papers o artículos de investigación ó papers. Escribir la bibliografía cuando se está escribiendo un artículo para alguna revista o tesis es una tarea engorrosa para alguien novato en el tema. Este programa hace más fácil todo eso.
Primero hay que saber ciertas nociones a la hora de tratar con artículos de investigación. Como las canciones mp3, estos archivos en pdf, tienen la posibilidad de ser etiquetados. Estas etiquetas permitirán añadir datos como el nombre del artículo, autor o revista para que puedan luego catalogarse mejor. Este método de asignar las etiquetas es lo que da trabajo porque se tiene que hacer uno a uno si el archivo no las incluye.
Papers tiene integrado un buscador enlazado con ciertas bases de datos como Google o PubMed y permite importar directamente los pdf, siempre que se esté suscrito a la revista o el artículo sea libre. Mediante esta importación, las etiquetas ya están añadidas y no hace falta reescribirlas. De todas formas, siempre habrá algún paper perdido que necesite ser editado.
La interfaz es muy similar al iTunes en cuanto a aspecto. En el panel principal se pueden ver a la izquierda las bases de datos (ya sean nuestras o del exterior), en el medio las publicaciones listadas con una miniventana con la preview del artículo que esté seleccionado y junto con botones de acceso rápido para imprimir o abrir el pdf completamente. Y a la derecha está el panel donde se encuentra toda esa información de las etiquetas del artículo y que se puede modificar con simples clics de ratón.

interfaz del Papers

A la hora de añadir una cita bibliográfica lo único que hay que hacer es arrastrar al documento que queremos completar y listo. Todo esto es configurable. También se pueden hacer cosas como sincronizar con el iPhone, pero no lo voy a contar todo!.
Sin embargo hay una pega: es de pago. Son 29€ si eres estudiante. Pero siempre se puede bajar la versión de 30 días para probarlo. Hay otros productos como Mendeley Desktop que está tanto para Mac como para PC, pero todavía no les he hechado el ojo. No he hablado del EndNote porque estamos en crisis y ese sí que cuesta una pasta.

Referencia: Papers

Escuchando: F*ck me I’m famous podcast

GTD para laboratorio

Ahora que he podido aprender la metodología del GTD (Getting things done) gracias a la ayuda de Berto Pena de ThinkWasabi y sus fantásticos screencasts, me he dado cuenta que desde hacía tiempo había utilizado un programa para Mac que se basaba en algo muy parecido: Lab Assistant.

Este software permite gestionar las tareas del laboratorio dividiéndolas en Cosas por hacer, recordatorios e incluso genera un log donde almacena todo lo que se ha ido recopilando quedando en un archivo de texto que puede servir como cuaderno de laboratorio digital.
Es una aplicación gratuita y desarrollada por el grupo de Mekentosj, famoso en creación de aplicaciones para uso en investigación. La única pega es que es una excusa más para estar pegado delante de la pantalla y el teclado, aunque en ocasiones haya que hacerlo.

Escuchando: nada de nada

Un gen del sueño

Aunque la mayoría de las personas suele dormir menos de ocho horas diarias (el promedio en un día no laboral es de 7,4 horas), y algunos sienten que pueden pasar con incluso menos cuando se dedican a actividades placenteras o de ocio en general, las evidencias científicas demuestran que, con el tiempo, el cuerpo sufre daños por este régimen de sueño escaso.
Tal como señala la neuróloga Ying-Hui Fu, coautora del estudio, y profesora en la Universidad de California en San Francisco, las alteraciones crónicas y a corto plazo en el número ideal de horas a dormir pueden traer serias consecuencias para la cognición, el estado anímico y la salud física, incluyendo el desarrollo de cáncer y alteraciones en las funciones endocrinas. Sin embargo, al principio este impacto puede quedar disfrazado con el consumo de estimulantes tales como el café y el chocolate.
En la nueva investigación, el equipo estudió una familia en la que una madre y su hija adulta habían tenido de por vida menores requerimientos de sueño que la mayoría de los individuos, seis horas por día en lugar de las ocho a ocho y media que, según estudios realizados, necesitamos los humanos para mantener una salud óptima. El laboratorio de Fu analizó muestras de sangre de estas mujeres y de sus parientes, e identificaron una mutación en un gen conocido como hDEC2, el cual es un factor de transcripción que reprime la expresión de otros genes y está implicado en la regulación de los ritmos circadianos.
A continuación, los investigadores modificaron genéticamente a ratones y moscas de la fruta para expresar el gen humano mutado, y estudiaron el impacto en sus patrones de sueño y en su comportamiento. Las observaciones demostraron que durmieron menos.
Luego, el equipo comparó la respuesta de los ratones modificados genéticamente con la de ratones normales ante las consecuencias de seis horas de privación del sueño. Los ratones modificados tuvieron necesidad de compensar su pérdida de horas de sueño en mucho menor grado que los normales.
Estos cambios en la necesidad de dormir de los ratones mutantes podrían proporcionar una explicación de por qué las personas con esta mutación son capaces de vivir sin ser afectadas a lo largo de sus vidas por la menor cantidad de horas de sueño.

Escuchando: 50 Cent – In my hood