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Raúl de la Puente

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Ocio

Jugando a alinear secuencias con Phylo

Logo de Phylo
Ya era hora de que saliera un jueguecito para los que analizamos secuencias. Se trata de Phylo (su nombre completo es ‘Phylo: A Human Computing Framework for Comparative Genomics’), que es un juego creado en flash (sí, como esos juegos en los que se cuidan animales y tal ;-D) consistente en alineamientos de secuencias. Trata de enseñar cómo alinear secuencias gracias a unas cajitas de colores que sustituyen los valores reales de ADN, ARN y proteínas (nucleótidos y aminoácidos para ser más exactos). El alineamiento que puede tocar puede ser por lo tanto tanto secuencias de ADN como de ARN como proteínicas. Para iniciarse en esto de los alineamientos y comprender un poco el “tema” no está mal. Tiene varios niveles y se juegan con especies más o menos emparentadas que generarán alineamientos más o menos complejos. También aumenta la dificultad con un temporizador para cada alineamiento.

Ejemplo del juego Phylo
Ejemplo del juego Phylo

El juego-puzzle ha sido desarrollado por el Departamento de Bioinformática de la Universidad McGill de Canadá. Se puede jugar contra la CPU o contra otros jugadores (previo registro) e incluso tus resultados pueden ser enviados a la Universidad de California para que puedan ser cotejados por ellos. Según dicen, esas secuencias del juego son ejemplos reales y que pueden servir los alineamientos conseguidos para avanzar en investigaciones basadas en análisis de secuencias.

Tendría que dedicar unos cuantos artículos para poder explicar claramente cómo se alinean secuencias y todos los programas que se pueden usar y las variables para que el alineamiento sea más efectivo. Pero no está mal juguetear un poco para sacar las primeras impresiones. Y tranquilos, seguro que más de uno se vuelve un poco loco.

Enlace al juego

Escuchando: Los Danko

Ineficacia del funcionariado como lastre evolutivo

Rectorado de León
Como este blog se basa en la experimentación y la experiencia, espero que esto sirva para los venideros universitarios porque a los que ya hemos pasado por el aro de todo lo que hacen (más bien no hacen) los funcionarios de las universidades, todo esto lo sabemos muy bien. En fin, en este artículo me quería referir a lo mal que te hacen pasar los funcionarios trabajadores de la Universidad. Esos que, en cuanto tienen que hacer un trámite que requiera un esfuerzo mayor al de hacer clic dos o tres veces en su grandísima y complicada interfaz tipo suite de ofimática y más de tres casillas para rellenar lanzan suspiros y te miran mal. Esos que, aún siendo tú un licenciado con un currículo bastante amplio y que te estás partiendo el culo por un sueldo mil eurista (si llega), no son capaces de tratarte de usted. Vaya por Dios!, menudo esfuerzo. A mi me han enseñado desde pequeño a tratar a las personas con educación y ni por asomo se me ocurre tutear a alguien que no conozco de primeras en el ámbito laboral. Ya se que soy un tiquismiquis, pero el respeto empieza por el ejemplo y las generaciones venideras están perdiendo ambos. Volviendo a las personas que deben tramitar los papeleos, pocas son las que te dicen buenos días antes de que tú lo digas o que te atienden con una sonrisa. No se si se creerán que todos los papeleos son para putearles, pero eso parece desde fuera. Eso sí, como conozcas a alguien del entorno y “marujees” un rato, tienes abiertas todas las puertas. Curioso ¿verdad?. Esos trabajadores que tienen como norma hora y media de café sin contar los pitillos o las visitas a las amigas/os de turno…ains!!. Os lo explico con un ejemplo práctico: aquí, en León, el rectorado (que es el lugar donde se debe tramitar todo el papeleo) se encuentra tal que a 45 minutos a toda castaña andando, 25 minutos si vas en bus y 13 minutos en bici (sí, lo tengo cronometrado). Bien, si se trabaja en el campus y más como yo en un laboratorio, tienes que diseñar tus proyectos con días de antelación en ocasiones para tener un tiempo para tramitar papeleos. (NOTA: me refiero a papeleos que estén fuera del correo interno, que menos mal, funciona relativamente bien para cosas que se responsabilizan ELLOS). Pues tienes que saber de antemano quién te tiene que atender para estimar cuándo toma el café y si fuma o no. Y si tiene un colegueo más que desarrollado para añadir sorpresas. Es fantástico. Y luego te suspiran, resoplan, miran mal, no te respetan y, por supuesto, no se esforzarán ni para hacer una fotocopia (a no ser de que apliques tácticas de integración social, marujeo…etc.).
No creo que se hayan parado a pensar alguna vez en lo que pasamos los verdaderos currantes para que estas personas tan ineficaces trabajen. Irónico.
Y todo esto tan sólo para la primera fase de los papeleos, porque la inoperancia en cuanto a revisiones de solicitudes, registros, reclamaciones y demás deberían revisarse con calma y yo no tendría espacio en el servidor para decir todo lo que se después de muchos años.
De todas formas, a todos los que empiecen con papeleos los recomiendo que tengan la mente en blanco cuando se enfrenten al funcionariado, si son irascibles por naturaleza que escuchen o vean antes de ir algo que les haga sonreir y que, si se tiene un día malo mejor dejar la visita para otro momento si es posible. Yo tengo amigos funcionarios y creo que en la Universidad se acentúa el problema. Soy tajante en esto pero es una verdad como un templo: sobran la mitad de esas personas y a la otra mitad habría que revisarlas. Y si no, id a la hora de fichar, contad a las personas que entran a trabajar, seguidlas a su puesto y luego repetid la operación a las 12 de la mañana. Sería un estudio estadístico con resultados bien conocidos.
Bueno, tengo la ligera esperanza que la selección natural acabe con ciertas cosas y que la genética me ayude un poco para eliminar de la evolución a esta raza que es muy pero que muy inferior a la media. Menuda afirmación más radical pensaréis, pero nada más lejos de la realidad. El avance científico se debe motivar y ayudar en la medida de lo posible y estos individuos están siendo un lastre que implica un retraso en el avance científico. Y creo que la ciencia tiene un cierto peso en nuestra forma de evolucionar, ¿no creéis?.
Espero no compartir con muchos esto que acabo de exponer, pero me da que hay cierta “clonación” en esto del funcionariado.

Pingchat: un aniquilador del SMS

Durante estos últimos días he podido experimentar con esta aplicación y merece analizarla un poco en este blog. Los resultados han sido los esperados: no más recursos de los necesarios, gran integración, multiplataforma y gratuita.pingchat Lo pueden disfrutar tanto los usuarios de iOS, como Android como Blackberry. Esto es lo que más me ha gustado, porque siempre habrá algún amiguete que tenga uno de los tres. Y si no, pronto lo tendrá seguro.
No es más que un sistema de mensajería y que, si se quiere, se integra en la agenda de contactos. Esto significa que se puede mandar el mensaje desde la propia agenda. Igual que un sms convencional. Es perfecto para quien disponga de conexión de datos, ya que podrá recibir los mensajes en todo momento. Pero no es algo imprescindible, puesto que si hay una red wifi al alcance, la usabilidad es la misma.
Me parece una grandísima alternativa a los mensajes de texto. La creación de grupos es otra de las características interesantes, más aún si se pueden adjuntar fotos y enlaces por el mismo precio: gratis. Os dejo un vídeo para que observéis el funcionamiento.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=1m1GCZMDzA0[/youtube] Aconsejo que lo probéis y podéis añadirme a vuestra agenda de Pingchat. Mi ID es doctorgenoma. Si tenéis alguna duda, comentadla.

Enlace a PingChat

Mesa para ver el Mundial

La verdad es que en estas fechas comienza a haber escasez científica. Y más con el calorcito que hace. Ya que España ha llegado a las semifinales, seguro que han surgido más forofos de la ROJA y todos se reunirán alrededor de una mesa con los refrescos y snacks preferidos para disfrutar del partido del Miércoles. Pues qué mejor que fabricar una mesa personalizada mundialista para el momento.

Como se ve en la imagen, lo único malo es disponer de 4 balones iguales en dimensiones (si no se quiere usar la fregona muy a menudo, claro). Lo mejor es que en la web que enlazo a continuación vienen las instrucciones detalladas para su fabricación.
Las banderitas que hay al lado de la tele presagiaban un duelo hispano-germánico…jejeje.

Web de referencia: Manualidades.tv

En busca de agua

No he podido pasar por alto un vídeo que he visto esta semana. Demuestra las estrategias que se tienen que manejar en ciertos lugares del mundo para lograr ciertos recursos naturales básicos como es el agua. El vídeo trata de cómo usar a un mono babuíno para encontrar agua. A esto se llama adaptación y el resto son tonterías. Espero que os guste.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=Umayn7JIgZ4[/youtube]

Escuchando: el termociclador con sus ventiladores que no dan tregua

Una de iPad con bacon

Ya que estamos en fin de semana, vamos a poner un punto de humor. Una empresa ya ha comercializado una nueva funda para el iPad.
iPad-Bacon-Case
Se llama la “iPad bacon case” y cuesta la friolera de 59 dólares. La verdad es que llamar la atención iba a llamar cualquier gadget metido ahí. ¿Tendrá olor a la misma pinta que tiene?

Fuente: Foolishgadgets

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