Raúl de la Puente

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Tecnología

Novedades en las búsquedas BLAST

Hace unos días me llegó la noticia de que la herramienta dedicada a las búsquedas BLAST en el NCBI se había actualizado ofreciendo novedades.
Al obtener los resultados aparece en la parte superior un enlace a un nuevo tipo de informe “View these results in the new enhanced report” junto otro enlace a un video de YouTube donde se detallan las nuevas opciones.

Entre ellas cabe destacar por su utilidad, la posibilidad de descargar únicamente las regiones de las secuencias de la base de datos que alinean con la nuestra, así como ver gráficamente alineamientos múltiples. Os animo a ver dicho vídeo explicativo de tres minutos:

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=yfITRIk34Js[/youtube]

Doy las gracias al Dr. Carlos Polanco del área de Genética de la Universidad de León por seguir enviando esos correos que ayudan a estar al día de estas pequeñas grandes cosas.

Los horrores del currículo normalizado

Imagen del currículum vítae normalizado
Como bien sabe la comunidad investigadora, el currículo normalizado es una herramienta de selección de personal que todos los investigadores deben tener actualizado. Hace que la selección de personal sea más eficiente. O eso espero. El problema estriba a la hora de generar ese curriculum vitae. En España existe un organismo, La Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología (FECYT) que nos “facilita” el desarrollo. Cosa que agradecemos mucho en un principio. Excepto cuando hay que trabajar con la aplicación que permite la generación de ese Currículum Vítae Normalizado (CVN).

Para los que no conozcan lo que es un CVN, la definición que ponen en la FECYT es la siguiente: “es un fichero electrónico en formato PDF (CVN-PDF) con tecnología CVN-XML incrustada, de tal manera que esta información normalizada puede ser tratada electrónicamente por distintas bases de datos para de este modo evitar que los investigadores tengan que teclear su currículo normalizado en los formularios/aplicaciones que se utilizan para las distintas convocatorias”. Perfecto. El problema existe cuando vienen esas “distintas convocatorias”.

Por naturaleza humana, no solemos tener todos los CV actualizados al día que se presenta la candidatura para cada convocatoria. No somos máquinas y tenemos muchas cosas científicas que hacer todos los días. Por lo tanto, se produce un gran flujo de información proveniente de todos los que quieren actualizar el currículo normalizado. El problema es que se puede perfectamente pasar varios días para actualizarlo dependiendo de los campos a rellenar. Y esto desespera cuando se tiene poco tiempo para hacer estos trámites y más aún cuando las convocatorias literalmente vuelan.

En fin, sólo quería enseñar la problemática de los CVN a los que no lo conocían y desahogarme como les sucede a muchos de mi gremio. Los investigadores nos pasamos mucho tiempo en lides administrativas y ésta es una de las menos importantes (dentro de su gran importancia).
Por cierto, he escrito estas líneas mientras el navegador intentaba cargar una de mis publicaciones. ¿Sabéis lo que ha sucedido al final, verdad?.

NOTA IMPORTANTE: La Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología se ha disculpado de forma pública ante todos los “insensatos” que estábamos actualizando el CVN en estos momentos. Chapeau por ellos y muchas gracias desde aquí ;D

P.D.: Espero os hayáis dado cuenta de las distintas formas con y sin tildes con las que he escrito CV 😉

Probando Photo Sphere

Al fin he instalado en el Galaxy Nexus el paquete de aplicaciones de la nueva versión 4.2 de Jelly Bean donde se encuentran muchas mejoras. Una de ellas es la nueva aplicación para la cámara donde se puede utilizar la herramienta “photo sphere” para hacer instantáneas con aspecto envolvente. Dejo unas cuantas imágenes que he tomado en una localización que siempre es difícil de retratar para obtener todo el esplendor deseado. Este tipo de imágenes es imposible realizarlas sin una composición de varias imágenes por lo amplio del entorno a fotografiar.
La primera imagen fue para comprobar si es factible haciendo las fotos rápidamente y sin patrón a seguir, de un lado a otro. Y se ve porqué hay que ser “un poco ordenado”.

Primer intento con Photo Sphere
Primer intento algo fallido con Photo Sphere. Pulsar para agrandar.

En la segunda, intenté sacar una pequeña panorámica. Y no fue mal.

Segunda imagen con Photo Sphere. Pulsar para agrandar.
Segunda imagen con Photo Sphere. Pulsar para agrandar.

La última la saqué con la intención de captar toda la catedral de León.

Tercera imagen con Photo Sphere. Pulsar para agrandar.
Tercera imagen con Photo Sphere. Pulsar para agrandar.

Conclusiones: rápido procesamiento de la imagen, la imagen tiene un tamaño que no es la suma de todas las instantáneas y se deben hacer las fotos con cierto orden para que no haya saltos en la imagen final. Eso sí, tanto la nueva aplicación de cámara como el procesado de las imágenes “chupan” mucha batería.
En posteriores ocasiones iré añadiendo más para poder mostrar la capacidad del procesamiento de imágenes que ofrece Android.

Science Friday: de lo mejor para escuchar

Logo de Science Friday en Español
Voy a comentar una excelente forma de ocio científico gracias a uno de los mejores programas de divulgación que existen ahora mismo. Y no me quedo corto. Si eres un loco de la ciencia y tu inquietud sobre temas nuevos altera tus neuronas, este podcast es perfecto. Y no sólo por los temas que trata (ciencia, salud y tecnología) sino porque tanto el locutor como el ritmo y el cuidadísimo audio hacen que sea uno de los podcasts que espero todos los viernes. Porque el título del propio programa es fiel a la periodicidad de publicación: todos los viernes estará disponible casi a primera hora en horario español.
Luis Quevedo es el culpable de que me tenga atrapado, ya que es la voz que transmite toda la temática de lo más multidisciplinar que inundará los oídos durante los 30 minutos que mantienen la atención automáticamente.
Noticias, entrevistas a los científicos responsables de los estudios más punteros a nivel mundial y todo en español, ya que Science Friday es un portal estadounidense dedicado a la ciencia y tecnología con programas emitidos en la Radio Nacional Pública (NPR) y que ya los escuchaba antes, aunque no tan asiduamente como esta edición en mi lengua materna.
Lo mejor es que es divulgación en estado puro. Todo lo explicado lo puede comprender cualquiera que preste atención. Además en el penúltimo episodio existe una charla sobre la dificultad de divulgar y la importancia de la comunicación científica ahora que somos el mayor número de científicos que ha existido jamás en la faz de la tierra.
Sin más, os animo a que os suscribáis. Pero ya. DESDE AQUÍ MISMO si queréis. Y disfrutad de la ciencia.

Fail al instalar Cyanogenmod 10 en Nexus S

imagen de información de sistema
Este fail no es algo que no tuviera en mente. Fue buscado, pero quería probarlo. Como no podría ser de otra forma, he esperado un tiempo a actualizar a la versión modificada de android 4.1 Jelly Bean de Cyanogen (en este caso ya la 4.1.2). Pero esta vez no he instalado de cero. He probado a actualizar el sistema. Cosa que no ocasionaría problemas, al menos en teoría. Sin embargo sabemos que existen dos paquetes de aplicaciones de Google que son diferentes para la versión de Android 4.0 y para la versión 4.1. Y esto es lo que ocurrió: al no ser compatibles el sistema iba perfecto pero ninguna de las aplicaciones como Gmail, calendario o Google play funcionaban. Lo siguiente en probar fue si podría servir desinstalar alguna de estas aplicaciones e instalarlas de nuevo. Así probé con Gmail y el resultado fue el mismo.
Tras este falso Fail, opté rápidamente a poner las cosas en su sitio. Descargué la versión correspondiente de las aplicaciones de Google para Jelly Bean y listo.
Algunos usuarios han informado que tienen problemas con estas actualizaciones viniendo de versiones experimentales. Pues bien, estas versiones (también llamadas nightlies) son las que he usado casi siempre. Y he actualizado de ICS a JB de nightly a nightly. Incluso actualicé la versión de la radio, que la tenía más bien olvidada y puede que sea la culpable de los quebraderos de cabeza con pérdidas de cobertura de voz (que no de datos).
Tras un par de días con esta nueva CM10 puedo decir que no hay color comparando con la oficial que instalé en Julio. Interesante lo de borrar aplicaciones no instaladas desde la pestaña TODAS del Google Play. Va todo casi perfecto. Todo menos lo de siempre: la batería. Esperemos que poco a poco se vayan “ajustando” los kernels.
Si tenéis alguna duda, comentádmela.