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Raúl de la Puente

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Genética

Cambiando el código de la vida y los soportes digitales en @TrendingCiencia

Alfabeto Genético ampliado y bio-ordenadores
La nueva colaboración en Trending Ciencia, el podcast científico de moda, trata del último gran bombazo presentado en la revista Nature y publicado en su versión online el pasado 7 de mayo donde se explica la generación de un organismo semi-sintético en el que se ha ampliado su alfabeto genético añadiendo un par de bases nitrogenadas distintas a las cuatro del ADN (adenina, Guanina, Citosina y Timina).
Para terminar el programa de 7 minutos, una mención a la innovadora idea de utilizar el ADN como soporte digital. ¿Os imagináis cambiar los almacenamientos de información actuales por moléculas de ADN?.
Un programa que seguro no dejará a nadie indiferente.

No dudéis en comentar este episodio en esta misma entrada en la web o mediante las redes sociales mencionando nuestra cuenta oficial de Twitter @TrendingCiencia o personalmente al autor del programa, que soy yo,@DoctorGenoma. Y animad a todo al que le guste la ciencia a suscribirse a nuestro podcast mediante su FEED o a través de las plataformas iTunes e iVoox.

Enlaces de interés: A semi-synthetic organism with an expanded genetic alphabet
Código para leer y escribir con ADN

El hambre y su poder genético

Inanición en Camboya
El mes pasado se pudo conocer los resultados de un estudio realizado en tierras camboyanas donde se muestran datos esclarecedores de cómo los periodos de inanición provocados por las situaciones bélicas pueden desencadenar que nuestra genética sea peligrosamente modificada.

Actualmente la diabetes está siendo un gran problema en Camboya. En realidad no es algo sorpresivo. Ahora mismo se come mucho más, la gente tiene una vida media mayor y se realiza mucho menos ejercicio físico que en épocas anteriores. Sin embargo ciertos investigadores han estudiado este incremento y piensan que hay algo más detrás de un cambio en los hábitos y de la esperanza de vida.

Kim Keuky atendiendo a varias mujeres camboyanas diabéticas.
Kim Keuky atendiendo a varias mujeres camboyanas diabéticas. Foto: Kounila Keo.

Desde 1975 a 1979 Camboya fue gobernada por los Jemeres Rojos, régimen totalitario que acabó con la vida de entre 700000 y 2000000 de personas debido a los asesinatos y los muertos ocasionados por el hambre. El endocrinólogo Lim Keuky piensa que esos periodos de inanición han tenido gran culpa de los diagnósticos de diabetes que está observando en pacientes rondando los 30 años, edad muy temprana para desarrollar una diabetes de tipo 2 y más aún en el lugar donde le ha llamado la atención: una aldea rural donde viven muchos descendientes de las personas que sobrevivieron a las salvajadas de los Jemeres Rojos. Incluso, cuando viaja a otros países desarrollados y cuenta sus observaciones no le creen: “Cuando voy al extranjero a los países desarrollados, la gente dice que estoy mintiendo. No estoy mintiendo “, declara el endocrinólogo.

Pero es que esto no es un caso aislado de un país de oriente. Otro ejemplo lo tenemos más cerca, en occidente. Los investigadores en los Países Bajos, han notado un fenómeno similar. Ellos han estado estudiando a los supervivientes del “invierno del hambre”, un oscuro episodio durante la ocupación nazi de la Segunda Guerra Mundial.
En el invierno de 1944 a 1945, los nazis habían bloqueado todos los alimentos que llegaran a la zona occidental de los Países Bajos. La Doctora Rebecca Painter del Centro Médico Académico de Amsterdam dice que “la gente estaba recibiendo menos de 1.000 calorías al día”.
Painter y sus colegas decidieron hacer un seguimiento de una hipótesis de un médico inglés, David Barker, que tenía la teoría de que las condiciones en el útero pueden tener efectos permanentes en el desarrollo fetal.
Los investigadores holandeses examinaron muestras de sangre de las personas nacidas en la región afectada por el invierno del hambre. Encontraron que los nacidos durante la hambruna fueron significativamente más propensos a desarrollar diabetes o pre-diabetes a los 50 años en comparación con los nacidos sólo un año antes o después.
La hipótesis de Barker se denominó como el “fenotipo ahorrativo”. Los fetos en desarrollo en las madres que están recibiendo apenas lo suficiente para comer tienen que adaptarse. “Se adaptan de una manera que los pone en un mayor riesgo de desarrollar diabetes en la edad adulta “, explicaba David Baker . Con una toma insuficiente de nutrientes que viajan a través de la placenta, el páncreas del feto (que produce la insulina que previene la diabetes) no se desarrolla correctamente, dice la Doctora Painter.
Painter cree que el proceso está en el trabajo en Camboya. “Hay una buena probabilidad de que la inanición que Camboya vio a finales de 1970 puede contribuir a su actual aumento de la diabetes”, dice la Doctora.

Lim Keuky sospecha que el aumento de la diabetes se ha visto agravada por el hecho de que la disponibilidad de alimentos en Camboya es mucho mejor hoy que en años anteriores. Afirma que “Ahora tenemos mucho que comer y el páncreas no puede soportar la comida todos los días”. Además, dice que Camboya debe prepararse para un mayor número de casos de diabetes en los próximos años. Muchos camboyanos ignoran los primeros síntomas de la diabetes, tales como la sed o hambre excesiva, fatiga y adormecimiento en las manos o los pies. A la larga, la falta de tratamiento conduce a daños en los órganos que pueden ocasionar derrames cerebrales, insuficiencias cardíacas o insuficiencias renales, que pueden ser fatales.

Los expertos comentan ante tales evidencias que otros países en desarrollo, que han experimentado períodos de hambre, deben estar en la búsqueda de picos similares en diabetes. Investigadores en China informaron recientemente que los niños nacidos allí durante el período de tiempo de hambruna entre los años 1959 y 1961 eran más propensos a desarrollar diabetes en el futuro que las personas nacidas antes o después. También se han recibido informes similares de África meridional.

Pero esto llega a nivel genético. Los estudios en animales plantean una posibilidad aún más preocupante: “Hay un efecto multigeneracional”, dice la Doctora Painter . En otras palabras, los cambios en el funcionamiento de nuestros genes, que son causados por la hambruna, pueden transmitirse a las generaciones futuras. ¿Recordáis la epigenética? Recientemente se ha demostrado que algunos cambios epigenéticos son heredables. Eso significa que los camboyanos nacidos mucho después de aquel régimen de los Jemeres Rojos también pueden sufrir efectos físicos de aquellos años de brutalidad.

Esta entrada participa en el XXVIII Carnaval de Biología, organizado por David Ballesteros @BioBallesteros, cuyo blog anfitrión es Vida y Estrellas (Divulgación Científica).
XXVIII-biocarnaval

Referencias: The Khmer Rouge and Diabetes in Cambodia.

China explota la clonación a escala industrial en @TrendingCiencia

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En esta aparición en el programa de divulgación científica Trending Ciencia, podéis escucharme comentando la noticia de hace unos días referente a la utilización de las tecnologías de clonación por parte del gobierno Chino dirigidas al ganado porcino en pos de la investigación genética. Además, os pondréis al tanto del potencial de este gigante asiático en el campo de la secuenciación y su objetivo de clonar lo que llaman “animales adorables”.

No dudéis en comentar este episodio en esta misma entrada en la web o mediante las redes sociales mencionando nuestra cuenta oficial de Twitter @TrendingCiencia o personalmente al autor del programa, que soy yo,@DoctorGenoma. O es de más animar a todo el que le guste la ciencia a suscribirse a nuestro podcast mediante su FEED o a través de las plataformas iTunes e iVoox.


 

Referencia de la noticia: China cloning on an ‘industrial scale’

Clonetegration: un nuevo método de ingeniería genética

Se acaba de publicar un nuevo método de ingeniería genética que reduce drásticamente el tiempo y el esfuerzo necesarios para insertar genes exógenos en las bacterias, los caballos de batalla de la biotecnología. El artículo se encuentra en la revista ACS Synthetic Biology, y este novedoso estudio abre el camino para un desarrollo más rápido de los microorganismos “de diseño” que pueden utilizarse para el desarrollo de medicamentos, limpieza ambiental y muchas otras actividades.

Keith Shearwin y sus colaboradores explican que la colocación, o la integración, de una porción de ADN en el genoma de una bacteria es crítico para la obtención de bacterias de diseño. Ese ADN puede dar la capacidad a los microbios de resistencia ante ciertos antibióticos, por ejemplo, o la capacidad de generar sustancias que degraden el crudo después de un gran vertido.

Esquema de un modelo de Clonación de ADN. Pulsar para ampliar.
Esquema de un modelo de Clonación de ADN. Pulsar para ampliar.
Sin embargo, los métodos actuales de ingeniería genética son costosos tanto en tiempo como en multitud de pasos a realizar para llevarlos a cabo. Para hacer frente a estos inconvenientes, los investigadores han desarrollado una nueva tecnología de la ingeniería genética de un solo paso, al que llamaron “clonetegration” en referencia a los clones o copias de genes o fragmentos de ADN.
Los científicos, perteniecientes a un grupo de investigación combinado por la Universidad de Stanford (California, Estados Unidos) y la Universidad de Adelaida (Australia), describen el desarrollo de la técnica y su éxito en las pruebas de laboratorio realizadas mediante el método de “clonetegration” en bacterias E. coli y Salmonella typhimurium, muy utilizadas en biotecnología.
“El método es rápido, eficiente y fácil de hacer y se pueden integrar varios genes al mismo tiempo“, Dicen los investigadores. Además predicen que clonetegration “se convertirá en una técnica valiosa facilitar la ingeniería genética con secuencias difíciles de clonar y rápida construcción de los sistemas biológicos sintéticos.”

Esquema de la Clonetegration seriada
Esquema de la “Clonetegration” seriada.

Espero que pronto pueda tener acceso a este artículo y poder estudiar más detenidamente el proceso que proponen, porque mi curiosidad sobre este nuevo sistema de clonación no me va dejar dormir. Por ahora, empezaré a leer este suplemento de la publicación para ver si me convence.

Referencia “One-Step Cloning and Chromosomal Integration of DNA,” ACS Synthetic Biology. DOI: 10.1021/sb400021j

Entrevista en Científicamente Correcto

Hace unos días recibí una propuesta de Adrián, el responsable del blog Científicamente Correcto : hacerme una entrevista. ¡ Menuda sorpresa!. Sobre todo tras mi reciente doctorado. Estos detalles suben la moral científica ( y la no científica también ;D). Y más por el momento difícil por el que está pasando la investigación española.
En fin, si queréis conocerme un poco más os animo a que leáis esta entrevista. Os pongo el enlace a continuación. Y ya me contaréis que os ha parecido 😉

Entrevista a Raúl de la Puente en el blog Científicamente Correcto

Sienta bien un Ph. D.

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Después del largo camino, aquí me tenéis. Cambiando en todos los currículos, webs, redes y perfiles aquello de “estudiante de doctorado”. Ya soy Doctor. Bueno, como bien se dice, no se es Doctor hasta que no se pagan las tasas. Pero todo lo que tenía que hacer científicamente, ya está hecho. Si me seguís por las redes sociales, habréis podido leer aquello de “Paseando con traje y corbata sabiendo que soy DOCTOR con papeles. Indescriptible”. Todos los que han conseguido el grado, lo han sentido. En mi caso, mezcla de orgullo por la valoración de los expertos, satisfecho por como salió todo, contento por haber demostrado ante amigos y familia lo que se ha realizado durante todo este tiempo, agradecido por ciertos detalles de compañeros de departamento…todo ello mezclado con cierta inquietud por terminar una etapa y comenzar otra, muy dura en estos momentos por la mala situación.
Pero sienta bien cumplir el sueño de ser Doctor. Y, aunque algunos vayan diciendo cosas como “ya tenía ganas de terminar”…” se hacía pesado”…”menudo peso me he quitado de encima”…son palabrerías tópicas típicas de cara a la galería. Si son buenos investigadores, no será lo que hayan pensado de verdad. Y si no, debo ser un bicho raro. Un doctorado, se DISFRUTA. Luego, ya vendrán otras cosas 😉

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