Ciencia

Aquí encontrarás todo lo relacionado con la ciencia y su divulgación. Gran parte, desarrollado de la extinta web "Blog de laboratorio".

A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid

“We wish to suggest a structure for the salt of deoxyribose nucleic acid (D.N.A.). […]”. Así es como empieza el escrito enviado por James D. Watson y Francis H. C. Crick a la revista Nature en 1953 y que sería publicado en el volúmen 471 en casi dos páginas el 25 de Abril del mismo año.
Hace ya 58 años de la publicación y todavía sigue maravillándome cómo una página y 3 líneas han cambiado el mundo de la biología molecular. He querido colgar este escrito para que todos pudierais leerlo (aunque está en inglés) en su formato original (está en html5, pero si no lo podéis ver tenéis otro enlace con el texto a pantalla completa). De todas formas os pongo también un enlace con la traducción al español gracias al trabajo del Dr. C. de Paz que lo colgó en la web bioxeo.com hace unos cuantos años.

Molecular structure of nucleic acids

Para mí, cada vez que lo leo me permite hacer un repaso de las bases de la genética molecular. El último párrafo mencionando a otros investigadores muy relevantes para el descubrimiento (recomiendo ver el vídeo publicado en el anterior post) recuerda que este trabajo tuvo más ayuda.
Disfrutad del escrito, como lo he hecho yo.

Descubriendo la estructura del ADN

Por la conmemoración del quincuagésimo octavo aniversario del anuncio del descubrimiento de la estructura del ADN (el 28 de Febrero de 1953) y su posterior publicación en Nature (el 25 de abril de 1953) quería explicar un poco como fue todo lo relacionado con ese evento que ha cambiado “bastante” la Ciencia. Sin embargo me he topado con un vídeo que, por su duración y explicación, es más ameno que estar leyendo. Se mencionan los nombres de Wilkins, Franklin, Watson y Crick, la foto 51 y, además, cómo una cervecería volvió a ser el centro del mundo por unos momentos. Os dejo con el fragmento del documental “Watson y Crick y la doble hélice de ADN”.

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=uCm87Hn85Qk[/youtube]

Interesante, ¿no creéis?.

Escuchando: Gravina 82

Gestión bibliográfica con Paperpile

Ya se comentó en otro artículo las herramientas que había probado sobre gestión y administración de la bibliografía científica (y no científica). Sin embargo me llegó hace unos meses la invitación a probar una beta de una aplicación open source: Paperpile.

Se trata de una aplicación que está disponible para los sistemas UNIX Linux y MacOSX. Windows aún no tiene versión, pero están pensando en lanzarla pronto. Para poder probar esta beta hay que pedirlo mediante correo electrónico.
A mí que sea de código abierto ya hace que me atraiga más de lo normal. Que en Ciencia se distribuyan estas cosas gratuítamente y pensando en todas las funcionalidades abiertas, es más que un plus para probarlo al menos.
La interfaz es muy intuitiva. No es tan completa como otros software como Papers, pero se asemeja en lo limpia que es (ver imagen). A la izquierda todas la utilidades de gestión y navegación como la administración de las publicaciones por etiquetas, importación y exportación, suscripciones que se tengan a ciertos lectores de feeds que interesen o enlace a bases de datos bibliográficas. Se nota que está destinado a la investigación puesto que las bases de datos colocadas son Pubmed y Google Scholar y feed predefinidos los de Science, Nature y PLoS One.

interfaz de paperpile — Captura de pantalla con la interfaz de Paperpile versión 0.5.1 beta. Hacer clic o tap para agrandar

Para probar simplemente cómo exporta las citas por ejemplo, sólo tendréis que exportar vuestra bibliografía gestionada con otra aplicación a algún formato que lo pueda leer como es el BibText, RIS, o tipo xml o sqlite (como lo hacen Zotero o Mendeley).
Todavía es una versión beta y en su web tendréis la posibilidad de ver una galería de imágenes con muestras del funcionamiento e interfaz del programa así como las mejoras introducidas en cada nueva versión.
Probadlo y ya me diréis que os parece.

Web de Paperpile

Escuchando: Memoria histérica

Mejorando los recursos del blog

Este es un artículo algo atípico. Simplemente quería informar sobre ciertos cambios en la interfaz del blog y alguna que otra mejora que facilitará el intercambio de información.
Como podréis ver, la cantidad de botones referidos a las páginas del blog han disminuido. Esto es porque se han aglutinado todo lo que podrían llamarse RECURSOS en una página con ese nombre. Ahí podréis encontrar tanto ENLACES de interés relacionados con la investigación, SOFTWARE que ha sido analizado en el blog o de utilidad, información sobre el PODCASTING para todos aquellos que quieran pasar un buen rato con contenidos a la carta y una zona de SWITCHERS para los novatos en el mundo MAC.

Recursos en el Blog de laboratorio — Nuevos menús de la página de RECURSOS. Hacer clic o tap para agrandar

Pero, además, hay una novedad. El uso de las redes sociales facilita mucho el intercambio de información y la capacidad de compartir contenidos. Twitter (una de las redes sociales más de moda actualmente) permite mediante su API diseñar entornos como el que se ha creado para el Blog. Se ha podido generar un timeline especial que aglutina información referida a la investigación y temas similares. Este timeline está situado en la misma página de recursos y, de forma fija, en la barra lateral del blog. Por lo tanto se puede ver en todo momento desde cualquier página del blog.

Nuevo widget de Twitter con un timeline relacionado con temas científicos. Hacer clic o tap para agrandar.

Localización del widget de Twitter en la barra lateral del blog. Hacer clic o tap para agrandar.

Espero que estos cambios sean de vuestro agrado. Los contenidos se irán mejorando pero si tenéis alguna sugerencia para mejorar lo que sea, no dudéis en hacer un comentario o mandar un correo al mail destinado para ello.

Canalizando la fotosíntesis para generar combustible

Desde que pude escuchar por primera vez en el colegio cómo las plantas obtenían energía mediante la fotosíntesis, siento admiración por el reino vegetal. Con agua y dióxido de carbono más el aporte lumínico consiguen generar energía. Siempre hablando de la fotosíntesis de tipo oxigénico (ver imagen 1). Imaginad si se pudiera canalizar esa reacción de tal forma que se obtuviera energía que pudiéramos aprovecharla los seres humanos.

Fotosintesis oxigénica y anoxigénica — Imagen 1. Esquema de fotosintesis oxigénica y anoxigénica

Científicos del Reino Unido y los EE.UU., incluyendo investigadores de la Universidad Estatal de Arizona, han conseguido fondos (valorados en más de 10 millones de dólares, más de siete millones de euros) para mejorar el proceso de fotosíntesis, como medio de producción de combustible renovable.
Para resumir uno de los proyectos que se están llevando a cabo, lo que están estudiando es el procedimiento de conectar un organismo productor de energía con otro productor de combustible (ver imagen 2). Esto se basa en que las células fotosintéticas cuando son “abrumadas” por mucha luz llegan a desperdiciar energía. Consiguiendo canalizar esa energía sobrante a otros organismos que produzcan combustible se conseguiría mejorar esa eficiencia energética de una forma muy rentable para nosotros.

Esquema de proceso fotosintético canalizado — Imagen 2. Esquema del proceso de obtención de combustible mediante canalización de la fotosíntesis

No he podido indagar más sobre el tema pero parece ser que se están investigando en unos nanocables que permitan la conexión entre los dos tipos celulares para permitir el paso de electrones.
Este estudio se completa con otros tres proyectos : el proyecto EPP (Exploiting Prokaryotic Proteins to Improve Plant Photosynthesis Efficiency), el proyecto MAGIC (Multi-Level Approaches for Generating Carbon Dioxide) y el proyecto CAPP (Combining Algal and Plant Photosynthesis) y que en conjunto recibirán los fondos para la investigación anteriormente mencionados.
Buen proyecto para sacar partido al mundo vegetal de una forma más sostenible.

Imágenes obtenidas de la National Science foundation y Wikipedia.
Referencias: NSF Announces New Awards That Will Investigate More Efficient Ways to Harvest Sunlight to Make New Biofuels and Biomaterials

La tecnología para los científicos en Tecno

Me he encontrado con una grata sorpresa cuando esta mañana me dispuse a escuchar uno de los podcast sobre entrevistas a gente hablando sobre tecnología y cómo afecta a sus vidas llamado Tecno (@tecnopodcast en Twitter) y vi que era un científico el que estaba invitado.

Siempre que hablo con alguien fuera del trabajo sobre la situación tecnológica en los laboratorios me dicen cosas como “Ah! sí, como en CSI…”. Pues al igual que a mí, al Profesor Bacterio (científico bioquímico, @PrfBacterio en Twitter por si queréis seguirle) le inquietó el tema y contactó con el conductor del programa, Sebas oliva, y le propuso hacer este episodio. Y parecía que me estaba escuchando a mi mismo. En cuanto a la perspectiva. El trabajo es distinto, pero no importa. En la entrevista comentan los avances de la tecnología y cómo afecta a la ciencia tanto económicamente como en eficiencia, el tremendo cambio que ha provocado Internet en nuestras vidas científicas o el buen uso (que espero tener la oportunidad de darle algún día en un futuro no muy lejano) que se le da al iPad para estar al día en cuanto a publicaciones.
No quiero aburrir más sobre el tema. Por favor, escuchadlo. Yo me he sentido plenamente identificado y creo que la gran mayoría de los investigadores se sentirán como yo. No hace falta ser un geek. ¿Opináis lo mismo que yo?, ¿Os imagináis la Ciencia sin Internet?.

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