• Saltar a la navegación principal
  • Saltar al contenido principal
  • Saltar a la barra lateral principal

Raúl de la Puente

el espacio web de @DoctorGenoma

  • Correo electrónico
  • Facebook
  • Instagram
  • LinkedIn
  • Mastodon
  • Twitter
  • YouTube
  • Sobre mí
    • Contacto
  • Blog
    • Ciencia
    • Tecnología
    • Deporte
    • Fotolog
    • La Podcastfera
  • Mis Podcasts

Ciencia

Logo del antiguo Blog de laboratorio, ahora incluido en la página personal del director, autor y responsable de todas las publicaciones.

Aquí encontrarás todo lo relacionado con la ciencia y su divulgación. Gran parte, desarrollado de la extinta web "Blog de laboratorio".

Hablando con científicos: del zumo de limón al E-330. Aditivos alimentarios.

Siempre se está dudando y opinando sobre las etiquetas de los alimentos. Que si los que empiezan con la letra E y ciertos números son muy perjudiciales para la salud, que si cuantos más aditivos peor es el alimento…etc. En este episodio se habla con D. Miguel Calvo Rebollar, perteneciente a la rama de tecnología de los alimentos, que explica uno a uno esos códigos y qué son. Seguro que más de uno se tragará las palabras. Escuchádlo desde el enlace si no os queréis suscribir al podcast, que sólo dura 30 minutos.

Enlace del episodio

http://media.libsyn.com/media/cienciaes/en031_aditivos.mp3

Podcast: Reproducir en una nueva ventana | Descargar

SNPedia: una enciclopedia de los SNPs

Los polimorfismos de un único nucleótido (Single Nucleotide Polimorphism=SNP) son una de las variaciones más estudiadas en todos los genomas y, especialmente, en humanos. Estos SNPs (se lee esnips) no son más que variaciones de una sola base de la secuencia de ADN. Ahora también se consideran SNPs a unos cuantos nucleótidos que varían, como también pequeñas inserciones y deleciones pueden ser consideradas como SNP.

Ejemplo de SNP
Es una de las tareas en las que estoy embarcado en estos momentos y con el avance de las tecnologías cada vez se conoce más y se tienen más datos sobre este tipo de variaciones. Sólo un dato: el 90% de todas las variaciones del genoma humano pertenecen a SNPs. Por lo tanto, son numerosos los estudios que se basan en estos SNPs para detectar enfermedades. Y no sólo en la especie humana.
Quería compartir una base de datos muy importante en este campo: la SNPedia. Consta de un catálogo de los SNPs que se van descubriendo y secuenciando. Incluso están clasificándolos por genomas utilizados, genes involucrados y también medicinas que actúan mejor o peor dependiendo de tener o no estas variaciones.
Os dejo este enlace para la SNPedia y otro para su blog, donde actualmente han publicado los 10 SNPs más relevantes del pasado año. Me encantan estas cosas.

La inversión del Instituto de Genómica de Pekín

Trabajadores del BGI
El Beijing Genomics Institute (Instituto de Genómica de Pekín o BGI) está cada vez más encaminado hacia el dominio de la industria de la genómica desde que se fundara en 1999. Hace un tiempo comenté el claro posicionamiento de esta institución dentro del análisis genético. Pues bien, anteayer comenté que se había presentado el nuevo secuenciador Illumina Seq2000 armando un gran revuelo por el incremento del número de datos a obtener. El BGI ha comprado 128 de estas máquinas. Podréis hacer los cálculos de esta grandiosa inversión si por cada máquina se paga el precio de 650.000 dólares. Increíble.
Os dejo a continuación el mapa que localiza los sistemas de secuenciación en todo el mundo. Algo se está cociendo en China.

Enlace al mapa

Fuente: PolITigenomics

Nuevo secuenciador: HiSeq 2000

Seq2000
Esta semana ha sido presentado el nuevo “next-generation DNA sequencing method”, que ya se ha clasificado como de segunda generación: el Seq2000. Es de Illumina. Hay dos cambios importantes. El aumento del número de datos obtenidos pasa de 3Gb de datos por análisis a 200Gb. Y el área de análisis también se ha aumentado considerablemente. Eso es lo que se ha publicado recientemente. Pero he podido comprobar que el manejo de datos y análisis posterior podría generar problemas de tamaño, ya que incluso se comenta que para trabajar sin restricciones se deberían tener discos duros de 32 Terabytes. Alucinante.
La interfaz con el usuario también ha sido mejorada, pudiendo introducir datos mediante teclado o también gracias a la pantalla táctil.
Los precios de los que se hablan es de 650.000$ por el secuenciador y 10.000$ por los componentes y todo lo necesario para su funcionamiento. Lo bueno es que parece que hay cierta subvención a los propietarios de los aparatos Illumina anteriores a este.
Todavía no se habían instaurado los “antiguos” secuenciadores y ya hay más novedades. Y lo mejor creo que está por llegar en breve.

Fuente: Pathogenomics

El Gran Colisionador de Hadrones

Las preguntas sobre qué se hace en el CERN de Ginebra (La Organización Europea para la Investigación Nuclear. Tienen una cuenta en Twitter muy curiosa @cern) desde que se polemizó sobre el tema del fin del mundo han aumentado. El desconocimiento sobre la materia es lo que me ha llevado a exponer esta entrada en el blog. Después de escuchar el último episodio del podcast de la Buhardilla 2.0, me ha hecho recordar en una duda que tuvo un compañero de trabajo de mi padre hace varios años: ¿qué se hace en el CERN?. Pues qué mejor que ver un vídeo explicativo sobre el tema del Colisionador de Hadrones para despejar dudas. Hay que agradecer a AZURA888 la realización del vídeo. La voz en off deja que desear, pero por lo menos alguien se ha dignado en traducirla y colgarlo en español. Aquí os lo dejo:
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=T79nNX_5Pi0[/youtube]

Problemas epigenéticos en la fertilización in vitro

Menudo revuelo se está formando en torno al tema de la reproducción asistida. Desde hace unos años, el poder tener descendencia gracias a la fertilización in vitro había sido uno de los grandes avances científicos para nuestra especie. Pero parece ser que lo de jugar con la naturaleza no está muy bien visto por esta última. Se ha analizado el material hereditario de los hijos obtenidos mediante técnicas de fertilización in vitro y se ha observado una mayor probabilidad de que sean obesos o de desarrollar la diabetes.
La verdad es que el estudio ha tenido un muestreo algo bajo, pero se han encontrado grandes diferencias en la metilación del ADN. Esta metilación entra dentro de los carácteres denominados epigenéticos, esto significa que no dependen de la secuencia del genoma y esta información epigenética modula la expresión de los genes sin alterar la secuencia de ellos. Son como una etiqueta que indica que se deben expresar o no. Esto es la clave de la adquisición de esas anomalías como la obesidad o la diabetes. Los niños obtenidos mediante fertilización in vitro tienen una menor metilación y puede ser la causa de su desajuste a la hora de expresar ciertos genes como los descritos anteriormente.
De todas formas, esto abre una discusión sobre si esa “herencia epigenética” proviene de la técnica de fertilización o si los padres ya tenían una predisposición a generar ese individuo y que tuvieran también ciertas anomalías ligadas a esta metilación que incidiera en la probabilidad de tener descendencia. Como si fuera otro medio de selección. Curiosos los caminos de la naturaleza, ¿verdad?

  • « Ir a la página anterior
  • Página 1
  • Páginas intermedias omitidas …
  • Página 35
  • Página 36
  • Página 37
  • Página 38
  • Página 39
  • Páginas intermedias omitidas …
  • Página 54
  • Ir a la página siguiente »

Barra lateral principal

Logo del antiguo Blog de laboratorio, ahora incluido en la página personal del director, autor y responsable de todas las publicaciones.
Premio Innova

REDES SOCIALES DEL “BLOG DE LABORATORIO”

Raúl de la Puente - Derechos reservados© 2026 · Acceder

Utilizamos cookies propias y de terceros para garantizar el funcionamiento de la web, medir su uso y mejorar nuestros servicios. Puede aceptar todas las cookies, rechazar las no necesarias o configurar sus preferencias. Política de cookies

Configurar cookies

Necesarias para que la web funcione correctamente. No se pueden desactivar desde este panel.

Ayudan a medir el uso del sitio y mejorar sus contenidos.

Permiten publicidad, medición de campañas o personalización de anuncios.

Guardan preferencias o permiten contenido externo no necesario.