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Raúl de la Puente

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Ciencia

Logo del antiguo Blog de laboratorio, ahora incluido en la página personal del director, autor y responsable de todas las publicaciones.

Aquí encontrarás todo lo relacionado con la ciencia y su divulgación. Gran parte, desarrollado de la extinta web "Blog de laboratorio".

Software libre para la lectura por voz de la pantalla del ordenador

Jesús Merino Carretero, miembro del equipo de investigación de la Universidad de Extremadura Grupo de Redes Neuronales y Procesamiento de Señal (GRNPS), ha ideado la aplicación informática VITIS.
VITIS permite hacer una lectura de la pantalla para que un equipo informático pueda ser usado por personas ciegas o con problemas de visión. Además, es compatible con al menos un procesador de textos que le permita al usuario leer y escribir documentos con el fin de preparar apuntes, hacer trabajos o realizar exámenes.

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Plantas, evolución, sexo y el árbol de la vida

Las plantas evolucionan, como el resto de los seres vivos, pero su evolución se diferencia notablemente de la que acostumbramos a estudiar en los animales. Se puede descargar la entrevista con D. Pablo Vargas Gómez, investigador científico en el Real Jardín Botánico, en Madrid, directamente o mediante la suscripción al podcast Hablando con científicos, cuyo feed lo podéis descargar desde la página Podcasting del blog.

Enlace al archivo mp3 de la entrevista.

http://feedproxy.google.com/~r/HablandoConCientficos/~3/O03atRzvAG8/en025_vargas_evolplantas.mp3

Podcast: Reproducir en una nueva ventana | Descargar

Genes viejos, funciones nuevas

Investigadores del Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CBMSO) (CSIC-UAM), han puesto de manifiesto que el control de la expresión génica ejercido por los genes TIA-1 y TIAR (“viejos conocidos” que actúan como sensores celulares) es un acontecimiento complejo que implica la contribución de mecanismos moleculares diversos con el fin de regular programas celulares relevantes.
Los resultados derivados de este trabajo demuestran que estos dos genes son capaces de conectar y/o desconectar redes génicas complejas en el núcleo y en el citoplasma celular. De esta forma, alteran la dinámica transcriptómica (la colección de RNAs celulares) y modifican la progresión del ciclo celular y la capacidad de crecimiento de las células humanas.

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En cinco años el 25% de las publicaciones científicas serán sólo digitales

Salamanca acogió el taller de la Red de Bibliotecas Universitarias (Rebiun), un grupo de trabajo de la Conferencia de Rectores de las Universidades Españolas (CRUE). Los expertos reunidos en este encuentro manejan informes que indican que en cinco años el 25% de las publicaciones serán sólo digitales, de manera que las bibliotecas se preparan ya para “reinventarse”.

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Nueva técnica de detección de daño genético en espermatozoides

Hay buenas noticias para la supervivencia de la especie. En el trabajo realizado en la Unidad de Genética del Departamento de Biología de la Universidad Autónoma de Madrid, se describe un nuevo método para evaluar la fragmentación del ADN del espermatozoide humano. Esta técnica podría tener importantes aplicaciones en el campo de la fertilidad humana y la patología andrológica.
La base de la técnica que utilizan es la siguiente: los espermatozoides se lisan con detergentes y sales en altas concentraciones y el ADN liberado se somete a una electroforesis. Por la acción de un campo eléctrico, los fragmentos de ADN roto, se desplazan y generan una imagen parecida a un cometa, con un núcleo y una cola de fragmentos. La cantidad de daño en el ADN se cuantifica midiendo la longitud y la densidad de la cola del cometa. Cuanto más larga y/o densa es esta cola, mayor es el daño de ADN.

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AmplifX

Estamos ante un programa muy básico que permite simular PCRs y así permite verificar que los primers diseñados para amplificar una secuencia específica, están bien construidos. Esta aplicación permite guardar los primers a modo de base de datos. Así se pueden tener varias parejas de cebadores guardadas y probar con varios fragmentos de ADN secuenciados para probar la reacción de amplificación.

Tiene una funcionalidad añadida: informa sobre la teórica temperatura de anillamiento óptima para llevar a cabo la amplificación de forma específica. Sin embargo es mejor seguir con las indicaciones habituales que seguir esta recomendación (lo he podido comprobar en amplificaciones específicas). Así también, al añadir la pareja de cebadores, muestra un diálogo que comenta la temperatura de fusión, porcentaje de c+g o la estabilidad del extremo 3’ entre otros parámetros.
Es otra herramienta que puede facilitar algo el trabajo del laboratorio.

Enlace AmplifX

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