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Raúl de la Puente

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Ciencia

Logo del antiguo Blog de laboratorio, ahora incluido en la página personal del director, autor y responsable de todas las publicaciones.

Aquí encontrarás todo lo relacionado con la ciencia y su divulgación. Gran parte, desarrollado de la extinta web "Blog de laboratorio".

El primer mapa del epigenoma humano

Recientemente el grupo del Profesor Joshep Ecker del Instituto Salk de Estados Unidos ha publicado el primer mapa del epigenoma humano. Para recordar un poco, la epigenética, término acuñado por Conrad Waddington en 1937, se puede definir como el estudio de los cambios hereditarios o, al menos, potencialmente heredables experimentados por el material genético y no debidos a alteraciones en la secuencia del DNA. El factor epigenético más estudiado en eucariotas es la metilación del DNA y hace ya más de 30 años que se propuso su posible relación con el control de la función génica. Por otro lado, como el DNA eucariótico no se encuentra desnudo en las células, sino en forma de cromatina —un complejo con proteínas, entre las que sobresalen las histonas—, la expresión de la información contenida en los genes depende en gran medida de la organización de la cromatina y de las modificaciones que sufren las histonas, modificaciones que constituyen otros factores epigenéticos.
De esta forma se amplía el conocimiento a los caracteres epigenéticos que son claves en el desarrollo de terapias que tienen como blanco estos cambios no hereditarios y que son causantes de ciertas enfermedades comunes como la sordera o hasta varios tipos de cáncer.
Enlace del artículo en Nature

The Ig® Nobel Prizes

Vamos a hablar de la cara divertida de la ciencia. Así como los Oscar tienen sus competidores en los Razzies, la ciencia también tiene sus antinobel: los Ig® Nobel Prizes. “Ig” viene irónicamente por Inmunoglobulina. Los premios comenzaron en 1991 y se celebran cada mes de Octubre. Este año se han repartido los siguientes premios según categoría:
–Paz. Concedido a un grupo de científicos de la Universidad de Berna que han conseguido demostrar -con casos prácticos- que un golpe en la cabeza con una botella de cerveza vacía es más peligroso una llena.
–Veterinaria. Catherine Doyuglas y Peter Rowlinson, de la Universidad de Newcastle (Reino Unido), han demostrado que un trato personalizado hacia las vacas puede resultar más rentable: aquéllas con nombre propio dieron una mayor cantidad de leche que las que recibieron un trato “impersonal”.
–Medicina. Donald L. Unger, de Thousand Oaks (Estados Unidos), por hacer crujir los nudillos de su mano izquierda durante 60 años y probar así probar así que ese acto cotidiano produce artritis.
–Física. La profesora de la Universidad de Cincinnati Katherine K. Whitcome consiguió desvelar, mediante un análisis científico, el misterio de por qué las mujeres embarazas no pierden el equilibrio.
–Economía. Este premio ha ido a parar a los directores, ejecutivos y auditores de cuentas de cuatro bancos islandeses, por demostrar “que los pequeños bancos pueden transformarse en bancos enormes y viceversa y demostrar que lo mismo se puede aplicar a una economía nacional entera”, explican desde Improbable Research.
–Matemáticas. Recae en el presidente del Banco de Reservas de Zimbabue, Gideon Gono, por emitir recibos desde los 0,01 dólares hasta los 100 billones de dólares, en referencia al desigual reparto de riqueza de su país.
–Literatura. Otorgado a la Policía de Irlanda por haber puesto más de cincuenta multas al ‘recordman’ de las infracciones de tráfico en su país: un hombre que dio el nombre de Prawo Jazdy, palabras que en polaco significan “carné de conducir”.
–Biología. Fue a parar a Japón, donde científicos de la Universidad de Sagamihara demostraron que se puede reducir la masa de los residuos orgánicos generados por un hogar utilizando una bacteria extraída de las heces del oso panda gigante.

Todos y cada uno son trabajos de investigación con publicación y, en vez de ser simplemente algo jocoso, demuestra que la ciencia no tiene límites. Todo un ejemplo del sentido del humor científico.

Web de organizadores de The Ig® Nobel Prizes

AmpliGrid: sistema de PCR sobre célula única

Esta mañana he podido asistir a una conferencia sobre una nueva tecnología desarrollada por Olympus: el sistema AmpliGrid. Este invento tiene como estrella la placa AmpliGrid. Consiste en una placa parecida a los portas de microscopía, donde se depositan hasta un número de 48 muestras. Su función es de soporte para realizar amplificaciones de PCR con gran eficiencia. Los “pocillos” donde deben ser colocadas las muestras tienen una parte hidrofóbica externa y una región hidrofílica interna. De este modo, las reacciones permanecerán en el centro. Para que no haya evaporaciones, se cubre cada muestra con una gota de aceite mineral. Lo novedoso del sistema está en la reducción de costes a la hora de los reactivos para hacer PCR. El volumen total de reacción es de 1 microlitro. Por lo tanto, en los laboratorios que tienen como volumen estándar de reacción 25 microlitros, el ahorro será de más de 20 veces. No son necesarios reactivos pertenecientes a la marca que lo comercializa, por lo que se pueden utilizar en un principio todo tipo de componentes y marcas. También es compatible con la mayoría de los robots destinados a la automatización de manipulación de muestras. El kit de 4 placas más ciertos reactivos es de 50€.

AmpliGrid
El sistema termociclador es el AmpliSpeed. Es un aparato de reducidísimas dimensiones (menor que una caja de zapatos) con capacidad para una placa o, si se quiere aumentar la producción (ya que es modulable), 2 ó 4 placas. Consta de una pantalla táctil con una interfaz en color pero de reducida visibilidad, con un lector de tarjetas SD de hasta 1Gb y posibilidad de conexión ethernet (por ahora para PC). El módulo principal (pantalla, módulo de amplificación para una placa y alimentación) tiene un coste de 9.800€. Si se quiere ampliar, cada módulo a mayores cuesta 5.000€. La disipación del calor se realiza mediante placas térmicas y no existe ruido de ventiladores.
AmpliSpeed
El sistema tiene buena pinta. Pero sobre todo es muy de tener en cuenta por el servicio de pre-venta: si se tiene un protocolo de amplificación muy específico e interesaría dar el salto a este sistema, se puede pedir mediante forumulario una prueba de reacción en un sistema Ampligrid con AmpliSpeed sin comprarlo. Una vez obtenidos los resultados después de un tiempo, se puede optar por adquirir el equipo o no. De igual forma, su equipo de desarrollo permite obtener nuevos protocolos de PCR ajustados después de obtener la máquina. Incluso una vez adquirida hay un período de prueba.

Más información: Sección Advalytix

Kindle de Amazon

Esta tarde escuchando uno de los podcasts de treki.23, oí por primera vez la palabra Kindle e iba asociada con la megastore Amazon. Por el contexto sabía que algo tenía que ver con libros electrónicos. Así que me puse a indagar y averigué de qué iba ese dispositivo. Era un ebook reader ó lector de libros electrónicos. Pero me inquietó lo del tema de la conexión referente a unos problemas que hubo sobre licencias (escuchad el podcast número 49 de treki23). El dispositivo se conecta de forma inalámbrica a una red propiedad de Amazon llamada Whispernet que funciona a través de la red de telefonía movil (Sprint en Estados Unidos, aun sin confirmar en el resto de paises) para descargar los contenidos. Y la historia es que no necesitas otro dispositivo para descargar los libros. De esta forma, por ejemplo, se puede uno estar suscrito a un periódico y descargarselo directamente en el kindle mediante su tecnología wireless. Ahora entiendo la utilidad del aparatito. Ya estoy con ganas de tener uno en las manos para ver como funciona. El conocimiento me corroe y eso sería perfecto.

Escuchando: el traqueteo del disco duro externo haciendo el backup de turno.

Plataforma audiovisual 2.0 para la investigación y la docencia

Mañana día 15 se presentará a la comunidad universitaria, a los medios y a la opinión pública, el CanalUNED, 24 horas de programación, difusión y distribución de contenidos educativos y culturales de audio, radio, vídeo y TV por Internet.Documentales, reportajes, videoclases, mesas redondas, noticieros informativos, cobertura en directo y diferido de actos institucionales, académicos y de investigación, son algunos de los formatos y contenidos audiovisuales que en línea y bajo demanda se podrán ver, descargar, enlazar por medio de otros servicios interactivos como la accesibilidad audiovisual para la discapacidad auditiva (subtitulado) y visual (en un próximo futuro con la audiodescripción), guías de usos didácticos o pedagógicos con documentación y enlaces electrónicos complementarios, chats y foros de debate, suscripciones RSS, y desarrollo de una red social de blogs audiovisuales para compartir y generar diferentes contenidos audiovisuales.

Leer más…

VI Seminario de citogenética

El VI seminario de citogenética se celebrará en Córdoba entre los días 29 y 2 de octubre de 2010. Si se trabaja en este área de la genética es aconsejable ir por la buena organización de eventos en esta ciudad andaluza. Os dejo los enlaces para informarse mejor:

Lugar de celebración: Hotel Hesperia Córdoba
Web del Seminario: http://www.seminariodecitogenetica.org
Contacto: citogenetica.uco@gmail.com

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