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Raúl de la Puente

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En el blog encontrarás todas las entradas correspondientes a artículos publicados no pertenecientes al podcast ni al fotolog. Temas variados correspondientes a las inquietudes que me surgen en el día a día: tecnología informática Linux, Windows y MacOS; de dispositivos Android, iOS y Raspbian; sobre el estilo de vida fitness; algo de Ciencia, incluyendo referencias a mi blogdelaboratorio.com; viajes y opiniones varias que sirven en ocasiones para hacer terapia y otras para mostrar incoherencias.

 

Making of: Avatar

Esta superproducción ha generado opiniones de todo tipo. Hasta en el laboratorio ha experimentado cierto revuelo y muchos ratos de tertulias. Ahora nos muestran el making of de la película. Os dejo el vídeo de menos de 25 minutos. Disfrutad del verdadero origen de Pandora.

Escuchando: podcast 68 de Kafelog

Hablando con científicos: del zumo de limón al E-330. Aditivos alimentarios.

Siempre se está dudando y opinando sobre las etiquetas de los alimentos. Que si los que empiezan con la letra E y ciertos números son muy perjudiciales para la salud, que si cuantos más aditivos peor es el alimento…etc. En este episodio se habla con D. Miguel Calvo Rebollar, perteneciente a la rama de tecnología de los alimentos, que explica uno a uno esos códigos y qué son. Seguro que más de uno se tragará las palabras. Escuchádlo desde el enlace si no os queréis suscribir al podcast, que sólo dura 30 minutos.

Enlace del episodio

http://media.libsyn.com/media/cienciaes/en031_aditivos.mp3

Podcast: Reproducir en una nueva ventana | Descargar

SNPedia: una enciclopedia de los SNPs

Los polimorfismos de un único nucleótido (Single Nucleotide Polimorphism=SNP) son una de las variaciones más estudiadas en todos los genomas y, especialmente, en humanos. Estos SNPs (se lee esnips) no son más que variaciones de una sola base de la secuencia de ADN. Ahora también se consideran SNPs a unos cuantos nucleótidos que varían, como también pequeñas inserciones y deleciones pueden ser consideradas como SNP.

Ejemplo de SNP
Es una de las tareas en las que estoy embarcado en estos momentos y con el avance de las tecnologías cada vez se conoce más y se tienen más datos sobre este tipo de variaciones. Sólo un dato: el 90% de todas las variaciones del genoma humano pertenecen a SNPs. Por lo tanto, son numerosos los estudios que se basan en estos SNPs para detectar enfermedades. Y no sólo en la especie humana.
Quería compartir una base de datos muy importante en este campo: la SNPedia. Consta de un catálogo de los SNPs que se van descubriendo y secuenciando. Incluso están clasificándolos por genomas utilizados, genes involucrados y también medicinas que actúan mejor o peor dependiendo de tener o no estas variaciones.
Os dejo este enlace para la SNPedia y otro para su blog, donde actualmente han publicado los 10 SNPs más relevantes del pasado año. Me encantan estas cosas.

Dietas y Spinning en Irrecomendando

La vuelta de las vacaciones hace estragos en la mayoría de la gente. Y no sólo por el factor monetario, sino también en el físico. Las ganas de perder unos kilitos siempre encaminan a dietas fugaces y pastillas que tienen como única función robar el dinero de la gente. Siempre he comentado lo importante que es llevar un conteo de lo que se toma. En musculación todo es más estricto pero, para perder los kilos que se han ganado en las navidades, no habría más que seguir las recomendaciones de @irre10 (en Twitter) de este episodio. Y no lo dice un “actor” con bata blanca sentado y bonachón, sino alguien que lo ha experimentado en sus carnes. Al final comenta algo sobre un deporte que todavía no he tenido el gusto de practicar, el spinning, pero que con lo que me gusta la bicicleta de montaña y sudar no habrá más que proponérselo. Si os queréis suscribir al podcast, podéis hacerlo desde mi sección “ocio” de podcasting.

Enlace al episodio

La inversión del Instituto de Genómica de Pekín

Trabajadores del BGI
El Beijing Genomics Institute (Instituto de Genómica de Pekín o BGI) está cada vez más encaminado hacia el dominio de la industria de la genómica desde que se fundara en 1999. Hace un tiempo comenté el claro posicionamiento de esta institución dentro del análisis genético. Pues bien, anteayer comenté que se había presentado el nuevo secuenciador Illumina Seq2000 armando un gran revuelo por el incremento del número de datos a obtener. El BGI ha comprado 128 de estas máquinas. Podréis hacer los cálculos de esta grandiosa inversión si por cada máquina se paga el precio de 650.000 dólares. Increíble.
Os dejo a continuación el mapa que localiza los sistemas de secuenciación en todo el mundo. Algo se está cociendo en China.

Enlace al mapa

Fuente: PolITigenomics

Nuevo secuenciador: HiSeq 2000

Seq2000
Esta semana ha sido presentado el nuevo “next-generation DNA sequencing method”, que ya se ha clasificado como de segunda generación: el Seq2000. Es de Illumina. Hay dos cambios importantes. El aumento del número de datos obtenidos pasa de 3Gb de datos por análisis a 200Gb. Y el área de análisis también se ha aumentado considerablemente. Eso es lo que se ha publicado recientemente. Pero he podido comprobar que el manejo de datos y análisis posterior podría generar problemas de tamaño, ya que incluso se comenta que para trabajar sin restricciones se deberían tener discos duros de 32 Terabytes. Alucinante.
La interfaz con el usuario también ha sido mejorada, pudiendo introducir datos mediante teclado o también gracias a la pantalla táctil.
Los precios de los que se hablan es de 650.000$ por el secuenciador y 10.000$ por los componentes y todo lo necesario para su funcionamiento. Lo bueno es que parece que hay cierta subvención a los propietarios de los aparatos Illumina anteriores a este.
Todavía no se habían instaurado los “antiguos” secuenciadores y ya hay más novedades. Y lo mejor creo que está por llegar en breve.

Fuente: Pathogenomics

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