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Raúl de la Puente

el espacio web de @DoctorGenoma

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Nuevos iMac y Mac mini

Ya han llegado los nuevos iMac. Las pantallas son todas LED, vienen de serie el teclado y ratón Magic mouse inalámbricos, empiezan a añadir los procesadores de 4 núcleos…Pero lo que más se nota son la estética de las pantallas. La más pequeña es de 21,5 pulgadas. Alucinante. Está muy bien la evolución que han colgado en la web de Apple sobre la evolución del iMac. Ahora sí que parece tan sólo una pantallita de nada.
En cuanto a los Mac mini, lo mejor es el precio: 549€. Ese precio incluye un procesador Core2Dúo 2.26Ghz. 2Gb de RAM, 160Gb de disco duro y Geforce 9400M. Me parece la mejor idea si se quiere iniciar en el mundo maquero y no quiere tirar todos los periféricos.
Estudiantes, yo no dejaría pasar ahora la ocasión

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Nuevo Instituto de Biodiversidad en la UB

Ha sido inaugurado el nuevo Instituto de Biodiversidad en la Universidad de Barcelona. Según sus directrices, este nuevo instituto has sido construído para potenciar la investigación, para mejorar la comprensión de la biodiversidad, la gestión del medioambiente y el desarrollo sostenible, y fomentar la investigación científica de excelencia básica y aplicada de carácter multidisciplinario. Buenas ideas. Ahora sólo hace falta que se hagan realidad. Mal tiempo intentar sacar a flote un nuevo centro de investigación. Ánimo para ellos.
Web de la IRBio

Configurar e-mail en Nokia n95

La descarga del correo mediante el uso del navegador web que viene integrado en el sistema operativo Symbian es más que tediosa. A parte de lenta. Desde hace un tiempo, las compañías de correo gratuíto Hotmail, Yahoo y Gmail, permiten configurar el gestor de correo que viene instalado en el N95. Está en la sección de mensajes. Simplemente habrá que configurar los parámetros para poder descargarse el correo o enviar algún e-mail utilizando directamente las bandejas de entrada y salida de cada servidor. Esto evita tiempo y estar pendiente de introducir claves y nombres de usuario.
La configuración se encuentra en cada uno de los correos ya creados y entrar en ajustes de conexión dentro de opciones del buzón de correo. Empecemos:

HOTMAIL

Correo entrante       Nombre de usuario: xxxxx@hotmail.com
                                Contraseña: la propia de cada usuario
                                Servidor de correo entrante: pop3.live.com
                                Punto de acceso en uso: Preguntar siempre
                                Nombre de buzón: el que quiera el usuario
                                Tipo de buzón de correo: POP3
                                Seguridad (puertos): SSL/TLS
                                Puerto: Predeterminado
                                Acceso seguro APOP: Desactivado
Correo saliente        Dirección de correo propia: xxxxx@hotmail.com
                                Nombre de usuario: xxxxx@hotmail.com
                                Contraseña: la propia de cada usuario
                                Servidor de correo saliente: smtp.live.com
                                Punto de acceso en uso: Yo tengo «preguntar siempre»
                                Seguridad (puertos): SSL/TLS
                                Puerto: Predeterminado

YAHOO: se deben activar las opciones pop3 dentro de las opciones de cuentas de correo de la configuración del propio buzón.

Correo entrante        Nombre de usuario: xxxxx@yahoo.es
                                Contraseña: la propia de cada usuario
                                Servidor de correo entrante: pop3.correo.yahoo.es
                                Punto de acceso en uso: Preguntar siempre
                                Nombre de buzón: el que quiera el usuario
                                Tipo de buzón de correo: POP3
                                Seguridad (puertos): SSL/TLS
                                Puerto: Predeterminado
                                Acceso seguro APOP: Desactivado
Correo saliente        Dirección de correo propia: xxxxx@yahoo.es
                                Nombre de usuario: xxxxx@yahoo.es
                                Contraseña: la propia de cada usuario
                                Servidor de correo saliente: smtp.correo.yahoo.es
                                Punto de acceso en uso: Yo tengo «preguntar siempre»
                                Seguridad (puertos): SSL/TLS
                                Puerto: Predeterminado

GMAIL: se deben activar las opciones imap dentro de las opciones de cuentas de correo de la configuración del propio buzón.

Correo entrante        Nombre de usuario: xxxxx@gmail.com
                                Contraseña: la propia de cada usuario
                                Servidor de correo entrante: imap.gmail.com
                                Punto de acceso en uso: Preguntar siempre
                                Nombre de buzón: el que quiera el usuario
                                Tipo de buzón de correo: IMAP4
                                Seguridad (puertos): SSL/TLS
                                Puerto: Predeterminado
                                Acceso seguro APOP: Desactivado
Correo saliente        Dirección de correo propia: xxxxx@gmail.com
                                Nombre de usuario: xxxxx@gmail.com
                                Contraseña: la propia de cada usuario
                                Servidor de correo saliente: smtp.gmail.com
                                Punto de acceso en uso: Yo tengo «preguntar siempre»
                                Seguridad (puertos): StartTLS
                                Puerto: 587

Como brevemente he comentado en cada correo, hay que habilitar las opciones de pop3 ó imap de cada buzón para que permita el acceso del cliente que tengamos predefinido para extraer el correo de los servidores. Además, como ocurre en gmail, se puede indagar como completar las configuraciones en cada dispositivo.
Con esta configuración ya es posible asistir a cualquier reunión o congreso y, disponiendo de una red de datos, descargarse el correo casi tan rápido como leer un sms.

El primer mapa del epigenoma humano

Recientemente el grupo del Profesor Joshep Ecker del Instituto Salk de Estados Unidos ha publicado el primer mapa del epigenoma humano. Para recordar un poco, la epigenética, término acuñado por Conrad Waddington en 1937, se puede definir como el estudio de los cambios hereditarios o, al menos, potencialmente heredables experimentados por el material genético y no debidos a alteraciones en la secuencia del DNA. El factor epigenético más estudiado en eucariotas es la metilación del DNA y hace ya más de 30 años que se propuso su posible relación con el control de la función génica. Por otro lado, como el DNA eucariótico no se encuentra desnudo en las células, sino en forma de cromatina —un complejo con proteínas, entre las que sobresalen las histonas—, la expresión de la información contenida en los genes depende en gran medida de la organización de la cromatina y de las modificaciones que sufren las histonas, modificaciones que constituyen otros factores epigenéticos.
De esta forma se amplía el conocimiento a los caracteres epigenéticos que son claves en el desarrollo de terapias que tienen como blanco estos cambios no hereditarios y que son causantes de ciertas enfermedades comunes como la sordera o hasta varios tipos de cáncer.
Enlace del artículo en Nature

The Ig® Nobel Prizes

Vamos a hablar de la cara divertida de la ciencia. Así como los Oscar tienen sus competidores en los Razzies, la ciencia también tiene sus antinobel: los Ig® Nobel Prizes. “Ig” viene irónicamente por Inmunoglobulina. Los premios comenzaron en 1991 y se celebran cada mes de Octubre. Este año se han repartido los siguientes premios según categoría:
–Paz. Concedido a un grupo de científicos de la Universidad de Berna que han conseguido demostrar -con casos prácticos- que un golpe en la cabeza con una botella de cerveza vacía es más peligroso una llena.
–Veterinaria. Catherine Doyuglas y Peter Rowlinson, de la Universidad de Newcastle (Reino Unido), han demostrado que un trato personalizado hacia las vacas puede resultar más rentable: aquéllas con nombre propio dieron una mayor cantidad de leche que las que recibieron un trato “impersonal”.
–Medicina. Donald L. Unger, de Thousand Oaks (Estados Unidos), por hacer crujir los nudillos de su mano izquierda durante 60 años y probar así probar así que ese acto cotidiano produce artritis.
–Física. La profesora de la Universidad de Cincinnati Katherine K. Whitcome consiguió desvelar, mediante un análisis científico, el misterio de por qué las mujeres embarazas no pierden el equilibrio.
–Economía. Este premio ha ido a parar a los directores, ejecutivos y auditores de cuentas de cuatro bancos islandeses, por demostrar “que los pequeños bancos pueden transformarse en bancos enormes y viceversa y demostrar que lo mismo se puede aplicar a una economía nacional entera”, explican desde Improbable Research.
–Matemáticas. Recae en el presidente del Banco de Reservas de Zimbabue, Gideon Gono, por emitir recibos desde los 0,01 dólares hasta los 100 billones de dólares, en referencia al desigual reparto de riqueza de su país.
–Literatura. Otorgado a la Policía de Irlanda por haber puesto más de cincuenta multas al ‘recordman’ de las infracciones de tráfico en su país: un hombre que dio el nombre de Prawo Jazdy, palabras que en polaco significan “carné de conducir”.
–Biología. Fue a parar a Japón, donde científicos de la Universidad de Sagamihara demostraron que se puede reducir la masa de los residuos orgánicos generados por un hogar utilizando una bacteria extraída de las heces del oso panda gigante.

Todos y cada uno son trabajos de investigación con publicación y, en vez de ser simplemente algo jocoso, demuestra que la ciencia no tiene límites. Todo un ejemplo del sentido del humor científico.

Web de organizadores de The Ig® Nobel Prizes

AmpliGrid: sistema de PCR sobre célula única

Esta mañana he podido asistir a una conferencia sobre una nueva tecnología desarrollada por Olympus: el sistema AmpliGrid. Este invento tiene como estrella la placa AmpliGrid. Consiste en una placa parecida a los portas de microscopía, donde se depositan hasta un número de 48 muestras. Su función es de soporte para realizar amplificaciones de PCR con gran eficiencia. Los “pocillos” donde deben ser colocadas las muestras tienen una parte hidrofóbica externa y una región hidrofílica interna. De este modo, las reacciones permanecerán en el centro. Para que no haya evaporaciones, se cubre cada muestra con una gota de aceite mineral. Lo novedoso del sistema está en la reducción de costes a la hora de los reactivos para hacer PCR. El volumen total de reacción es de 1 microlitro. Por lo tanto, en los laboratorios que tienen como volumen estándar de reacción 25 microlitros, el ahorro será de más de 20 veces. No son necesarios reactivos pertenecientes a la marca que lo comercializa, por lo que se pueden utilizar en un principio todo tipo de componentes y marcas. También es compatible con la mayoría de los robots destinados a la automatización de manipulación de muestras. El kit de 4 placas más ciertos reactivos es de 50€.

AmpliGrid
El sistema termociclador es el AmpliSpeed. Es un aparato de reducidísimas dimensiones (menor que una caja de zapatos) con capacidad para una placa o, si se quiere aumentar la producción (ya que es modulable), 2 ó 4 placas. Consta de una pantalla táctil con una interfaz en color pero de reducida visibilidad, con un lector de tarjetas SD de hasta 1Gb y posibilidad de conexión ethernet (por ahora para PC). El módulo principal (pantalla, módulo de amplificación para una placa y alimentación) tiene un coste de 9.800€. Si se quiere ampliar, cada módulo a mayores cuesta 5.000€. La disipación del calor se realiza mediante placas térmicas y no existe ruido de ventiladores.
AmpliSpeed
El sistema tiene buena pinta. Pero sobre todo es muy de tener en cuenta por el servicio de pre-venta: si se tiene un protocolo de amplificación muy específico e interesaría dar el salto a este sistema, se puede pedir mediante forumulario una prueba de reacción en un sistema Ampligrid con AmpliSpeed sin comprarlo. Una vez obtenidos los resultados después de un tiempo, se puede optar por adquirir el equipo o no. De igual forma, su equipo de desarrollo permite obtener nuevos protocolos de PCR ajustados después de obtener la máquina. Incluso una vez adquirida hay un período de prueba.

Más información: Sección Advalytix

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