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En el blog encontrarás todas las entradas correspondientes a artículos publicados no pertenecientes al podcast ni al fotolog. Temas variados correspondientes a las inquietudes que me surgen en el día a día: tecnología informática Linux, Windows y MacOS; de dispositivos Android, iOS y Raspbian; sobre el estilo de vida fitness; algo de Ciencia, incluyendo referencias a mi blogdelaboratorio.com; viajes y opiniones varias que sirven en ocasiones para hacer terapia y otras para mostrar incoherencias.

Practicando con la química aislando la cocaína

Aunque sea tabú para muchos, he podido leer en un gran blog como es el de Apuntes científicos desde el MIT la ciencia que hay detrás de la obtención de cocaína. Marca el protocolo a seguir si se quiere obtener 1Kg de cocaína a partir de unos 100Kg de hojas de coca. Muy interesante, sobre todo desde el punto de vista químico. Os lo dejo a continuación a modo de cita:

De la hoja de coca a la cocaína
Si como hacen algunos poblados indígenas las secas y metes en tu boca junto con una bola de fragmentos calcáreos de caracola de mar quemada y triturada, poco a poco irás extrayendo e incorporando a tu organismo un alcaloide llamado cocaína que eliminará tu sensación de hambre, sed, cansancio, dolores, y te mantendrá estimulado durante todo el día. Pero también puedes recordar las clases de química de productos naturales (disciplina que busca identificar y extraer de la naturaleza sustancias con aplicaciones industriales, agroalimentarias, farmacológicas…) y llevar a cabo un proceso de extracción química ligeramente más elaborado: Recolectas 100 Kg de hojas de coca (necesitarás unas 6000 plantas) y te pasas media hora triturándolas. Luego añades 100 Kg de cal (óxido de calcio) y 200 Kg de sal común, y vas pisoteándolas durante una hora para ir rompiendo las paredes de las células vegetales y dejar libres las moléculas de cocaína. Tu objetivo químico entonces será separar dichas moléculas de todo el resto de componentes en esos grumos sucios de color verde oscuro. En química existen gran cantidad de técnicas de separación, pero una de las más utilizadas – especialmente en los laboratorios de productos naturales- es jugar con la polaridad de las moléculas y su afinidad relativa en ciertos solventes: ir añadiendo diferentes tipos de líquidos que disuelven unas sustancias y no otras, y quedándote en cada caso la fracción que te interese. Por ejemplo, disolventes orgánicos como la gasolina lo disuelven casi todo: introduces tu mezcla de hojas de coca, cal y sal en un bidón con 120 litros de gasolina, lo remueves durante dos horas, lo filtras, y ya puedes tirar los restos sólidos a la basura. Los componentes de la futura pasta de coca -junto con muchas otras sustancias- se habrán quedado en la fase líquida. Pero tú no quieres la gasolina para nada. Le añades 10 litros de agua con 50 miligramos de ácido sulfúrico concentrado, remueves enérgicamente durante 10 minutos para que todas las moléculas de la mezcla entren en contacto entre sí, y lo dejas reposar hasta que la fase acuosa y orgánica se separen debido a su diferente densidad. Estás haciendo una clásica decantación líquido-líquido. Conoces la polaridad de las moléculas de cocaína, y sabes que son mucho más afines a la mayor polaridad de la pequeña fase acuosa que queda en el fondo del recipiente. Coges un tubito, sitúas un extremo en el fondo, y succionas para traspasar a otro recipiente la mezcla transparente de agua, ácido, pasta de coca, sales, y todavía muchas otras sustancias. Eso hay que limpiarlo. Para ello vas añadiendo poco a poco 1 kg de permanganato potásico. Este compuesto neutralizará los restos de gasolina, cal y sal, y hará que se formen unos grumos sólidos de color marrón oscuro. Los filtrarás, y te quedarás de nuevo con el líquido transparente que irá goteando dentro de otro recipiente. Allí es donde se encuentra la mayor parte del alcaloide, disuelto gracias a que el pH es todavía considerablemente ácido. Entonces vuelves a jugar con las polaridades de las moléculas y su solubilidad: Vas añadiendo poco a poco sosa cáustica para ir neutralizando la acidez de la mezcla y disminuir su polaridad, hasta que una sustancia blanquecina empiece a precipitar. La filtras. Esa pasta contiene un 90% de cocaína. Si coges un poquito con el dedo y te la colocas sobre las encías, se anestesiará la zona dejando la misma sensación extraña que cuando el dentista te duerme un área de tu boca. Lo dejarás secar, y si el proceso ha funcionado correctamente tendrás 1 Kg de pasta de coca lista para ser vendida a narcotraficantes. A ellos sólo les quedará el paso de añadir acetona para limpiar las impurezas de químicos y dejar la cocaína en un estado de polvo ya preparado para su adulteración y posterior uso.

Curiosa la forma de aislar el alcaloide ¿verdad?. Espero que os haya gustado.

Enlace al artículo original

Shareaholic: la extensión perfecta para compartir

En este periodo de vacaciones, vamos a sacar partido al uso de internet. Pero sobre todo al manejo de los enlaces. Desde que se dispone de las redes sociales, compartir noticias o curiosidades forma parte del día a día. Pero la mayoría de la gente no conoce el potencial que tienen las extensiones de los navegadores. Shareaholic es una extensión que está disponible en casi todos los navegadores (Firefox, Safari, Google Chrome, Ópera, Internet Explorer) y que facilita sobremanera la navegación en la red y el tiempo destinado a ello.
Tiene asociado tanto Facebook como Twitter, acortadores de URLs, Buzz, Gmail, Posterous, Tumblr, GReader e incluso LinkedIn o Amazon. Se puede configurar para que aparezcan las opciones más usadas en el menú desplegable. Pero lo mejor es verlo en acción. He podido hacer un vídeo casi “al vuelo” sobre el funcionamiento (no he editado más que dos cosas y faltan uno buenos subtítulos), pero creo que queda bastante claro cómo se utiliza y, sobre todo, el tiempo que se gana con ello.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=r9zqpbL07d4[/youtube] Cómo habéis podido observar, no sé si fue el momento o la línea pero no conseguí enlazar con Tumblr. Minutos más tarde sí que lo logré, siendo más rápido que con Posterous.
Si tenéis alguna duda sobre su utilización o instalación, no dudéis en comentarla.

Enlace a la web de Shareaholic

Los test de ADN directos al consumidor

Así es como se denominan las pruebas genéticas que se pueden contratar para obtener información acerca de enfermedades de tipo hereditario. Si queréis ver alguna empresa que se dedica a estos negocios en el territorio español, os remito a la multitud de publicidad que rota por el blog. Sin embargo, quería dejar de un lado el negocio en sí y comentar sobre lo que verdaderamente proporcionan dichas pruebas DTC (direct to consumer). Esta semana se ha abierto un debate en numerosos blogs y redes como twitter sobre si merece la pena o no hacer las pruebas o si la información que ofrecen con los test es suficiente.
Lo primero que se tiene que dejar claro es que los factores genéticos no siempre son determinantes ante cierto tipo de enfermedades. Siempre se debe tener un seguimiento médico. Hay muchos factores distintos de los genéticos que hay que tener en cuenta. De sobra son conocidos las predisposiciones genéticas de determinadas etnias a trastornos genéticos como la anemia falciforme, por ejemplo. Los hábitos de vida y el ambiente pueden también “moldear” la aparición de la enfermedad hereditaria.
Pero lo curioso es cómo se debe manejar esa información. Una de las mayores empresas norteamericanas que se dedican a estas pruebas genéticas DTC, 23andMe (poseen pruebas para las mutaciones asociadas a fibrosis quística, enfermedad de Tay-Sachs, anemia de células falciformes, y muchas otras condiciones. Si tenéis un Android, podréis jugar un poco con la aplicación que comenté hace unos días.), dice que sabiendo que un niño tiene la oportunidad de nacer con una de estas enfermedades se puede facilitar la intervención temprana y mejorar los resultados. Eso sí, advierten que todos los exámenes de revisión cubren sólo un subconjunto de las posibles mutaciones de cada enfermedad. “Usted todavía podría llevar a una mutación, incluso si los resultados de una compañía de pruebas genéticas DTC dan un resultado negativo” dice Anne Wojcicki, presidenta y cofundadora de 23andMe.
Dependiendo de la compañía suministradora del test, los resultados pueden variar (ver el informe del U.S. Goverment Accountability Office). Muin Khoury, Director de Salud Pública de Genómica para la CDC, dice que: ” Si usted está tratando de averiguar su perfil de riesgo para la diabetes tipo II, por ejemplo, alguien podría decirle- “En base a los cinco genes que he analizado, tiene un riesgo mayor que la media de padecer la enfermedad. Pero si se agregan dos genes más, el riesgo podría bajar”-. Mientras que si se sabe la edad de alguien, género, raza, índice de masa corporal e historia familiar, ya se puede predecir con casi el 90 por ciento de certeza si sus hijos recibirán la diabetes tipo II. Y añade: “Asumamos que el informe dice que usted posee un riesgo ligeramente mayor que la media. ¿Se supone que el ejercicio puede disminuir el riesgo? Eso debería hacerse de todos modos. Si el conocimiento del genoma de hoy no me dice nada más de lo que ya sabe la gente, ¿por qué iba a gastar varios cientos de dólares?.

La verdad es que es un tema difícil de tratar. Ya fuera de la ética (dejo la polémica con la película GATTACA), todavía estos test están un paños menores. Y el consejo genético no es algo que se pueda dictar con una simple prueba estándar.
Cómo este tema tiene bastante importancia, se me ha ocurrido publicar una encuesta con una pregunta muy simple para responder ¿Estarías dispuesto/a a realizar una prueba genética DTC (directo al consumidor)?. Os dejo la encuesta AQUÍ para que votéis. Podéis dejar comentarios tanto en este post como en la propia encuesta.

Información interesante para discutir: What DTC Genetic Testing Can—and Can’t—Tell You; DNA dilemma (Newsweek); Informe sobre diferencias de test genéticos entre compañías;

Encuesta sobre pruebas genéticas DTC

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Nuevos métodos de lucha contra la malaria

Ciclo de vida de la Malaria. Hacer clic para agrandar.

Los investigadores de la Case Western Reserve University, desarrollaron técnicas para identificar rápidamente la evolución de la resistencia a los medicamentos en las cepas de la malaria. Su objetivo es permitir a la comunidad médica reaccionar con rapidez a la resistencia inevitable a dichos fármacos y con ello salvar vidas al tiempo que aumenta la vida útil de los medicamentos utilizados contra la enfermedad.
En la actualidad, seguimiento de la enfermedad requiere meses de ensayos clínicos. Los nuevos métodos pueden proporcionar más información en apenas unos días y de una forma más barata.
Los investigadores han adaptado los ensayos genéticos y el análisis matemático para descubrir y realizar un seguimiento de inmunidad contra la droga de la forma más mortífera de la enfermedad, causada por el parásito Plasmodium falciparum. Pero, la tecnología podría utilizarse para otras formas de la malaria y otras enfermedades.
“Cada año, alrededor de 1 millones a 2,5 millones de niños mueren como resultado directo de la malaria. Una estimación conservadora es que un niño muere de malaria cada 30 segundos”, dijo Peter Zimmerman, profesor en la Facultad de Medicina de la Case Western Reserve University. “No hay vacuna para parásitos de la malaria; dependemos de las drogas y la amenaza más grande es que los parásitos siguen evolucionando adquiriendo resistencia a dichos fármacos”, dijo Carol Hopkins Sibley, profesora de ciencias del genoma en la Universidad de Washington y director científico de la resistencia mundial contra la malaria.
Se ha realizado un estudio exhaustivo de muestras de sangre de más de 250 individuos de Papua Nueva Guinea infectados de malaria y se han analizado las muestras mediante distinta fluorescencia asignada a los marcadores de la enfermedad y se observaron las mutaciones que padecía el parásito en su genoma que le confería la resistencia a los medicamentos en cada caso.
En un análisis tradicional, las infecciones se representan por la fuerza de la señal fluorescente como puntos en una gráfica cartesiana. El grupo de infecciones sensible a los medicamentos a lo largo del eje x, la resistente a los medicamentos a lo largo del eje Y. Los que tienen ambas infecciones pueden ser en algún punto intermedio y aquellos sin infección se agruparían en los ejes cercanos al cero.
Pero, incluso cuando una desviación estándar fue introducida para dar cuenta de cruce entre las señales fluorescentes, no dieron un trazado limpio de quién se había infectado y con qué.
Drew P. Kourí, matemático que estaba trabajando en el laboratorio de Zimmerman, llevó el problema a Pedro J. Thomas, profesor asistente de matemáticas y biología. Dando vueltas al asunto, descubrieron que podían producir una imagen precisa al posicionar los puntos de datos usando coordenadas polares.
En este método, el eje x es igual a la de fluorescencia para la infección sensible a los medicamentos y el eje y es igual a la fluorescencia para la resistente a los medicamentos. Las 264 muestras de sangre se representan como puntos entre los ejes de acuerdo a la fuerza de la señal. Los resultados: 4 grupos diferentes que reflejan las cuatro posibles diagnósticos. Utilizando el análisis de coordenadas polares, 86 de las 264 muestras fueron reclasificados.
Zimmerman dijo que se necesitan más estudios para verificar que la resistencia a un medicamento específico está asociado con variantes genéticas específicas.
Se podrían buscar fondos para producir un programa de computadora que procesa automáticamente datos usando coordenadas polares: “Si hemos creado una herramienta de análisis de datos basado en la web, podría ser útil para los investigadores de campo sin experiencia matemáticos especializados”, dijo el profesor Thomas.
No he querido meterme en las fórmulas y métodos cartesianos que han llevado a los resultados porque tendría que pasarme unos días estudiándolos. Os remito al enlace del estudio, que proporciona el artículo al completo.
Es increíble lo ligados que siempre están los estudios matemáticos y la computación a las ciencias de la vida. Yo sigo sin entender por qué no hay una especialización en ramas como la bioinformática en la carrera de Biología. No una asignatura. Gente como yo, la sacaríamos mucho partido. Y esto es algo que lo hablamos en un congreso de Genética. Pero siempre se queda en eso: habladurías. Espero que os haya gustado.

Más información: BioMed Central Genetics

Los entresijos de una portabilidad de Vodafone a Yoigo

Definitivamente he dado el paso. Pero no para hacer la técnica del amago. No. Debo ser de los pocos que se cambia de compañía por lo que verdaderamente ofrecen (y se paga): las tarifas. Unas tarifas basadas en el uso que yo tengo del teléfono. Desde que internet tiene tantas posibilidades, contratar un plan de datos termina siendo necesario. Mi uso del plan de voz se restringe a recibir llamadas, unos sms a la gente que no tiene acceso a inet y llamadas esporádicas de menos de 8 minutos de duración. El contrato que “disfrutaba” con Vodafone era el plan de datos de internet móvil con un coste de 15€ y un plan de tarifas de voz normalito con los 9€ de consumo mínimo. A todo ello hay que aplicar los impuestos, por lo que la suma de la factura era de unos 27€. Antes no disponía de línea ADSL en casa, por lo que no era una mala opción para estar conectado en todo momento. Y más sabiendo hacer un tethering silencioso. Pero ahora ya tenemos un hogar al día en comunicaciones y ese gasto para mi línea de teléfono era innecesario. Máxime cuando mi mujer hace un uso del móvil mínimo.
Entonces apareció Yoigo. Una compañía que se ha posicionado muy bien con sus tarifas y que ha dado un paso más con su bono de datos. Un bono que entra dentro del consumo mínimo y que es perfecto para mí. Con poco más de 9€ (IVA incluido) tengo datos y sólo tengo que sumar las llamadas y sms. Y se dieron las condiciones óptimas para la portabilidad cuando ofertaron la tarjeta con tarifa del cero sin consumo mínimo, perfecta para mi pareja.
Después de más de 10 años con Vodafone, me satisface irme de sus redes. Estoy un poco harto de la política que se tiene con eso de captar clientes y no cuidar a los que ya se tiene. Tan sólo me han “mimado” cuando me he querido ir. Al conocer mi portabilidad, me llamaron para hacer una contraoferta y una posterior “recontraoferta” (menudo palabro). En primer lugar igualaron las tarifas de Yoigo y me ofrecieron no pagar el 50% del gasto de mi móvil por un año. Al no acceder, sumaron a lo anterior un año de internet gratis y un móvil de alta gama. Para un cliente normal era algo muy dulce para aceptar. Pero se toparon conmigo, que ya tengo un móvil casi insuperable y dos preguntas clave: estaré sujeto a permanencia? Y el iPhone 4 estaría dentro de la oferta? A la primera cuestión era obvio que sí. Y a la segunda, tenía que preguntar. No se lo creía que, aún así, dijera que no. Lo curioso es que he recibido otra llamada, de otro departamento que no era el de portabilidades, ofreciéndome un teléfono de alta gama (a eso se referían con un Samsung f480) llevándomelo a casa gratis todo POR SER CLIENTE DE VODAFONE. Toma ya! Ahora me reconocieron como CLIENTE. Wow!
Bueno, ahora estoy esperando la tarjeta de Yoigo y feliz de haber podido cambiarme comprobando lo ruines que son estos negocios de la telefonía móvil. Ahora estaré con Yoigo, pero sin permanencia alguna. Si no estoy contento con el servicio, me voy y punto. Las compañías deberían no poder aferrarse al tema de las permanencias para mantener clientes. Pero es demasiado utópico (para no decir imposible, vamos) querer que las compañías sólo ofrezcan tarifas y no móviles, que al final de todo se pagan con creces.

P.D.: Siento si hay algún error tipográfico, pero estoy escribiendo desde el Nexus y es algo cansino. 😛