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En el blog encontrarás todas las entradas correspondientes a artículos publicados no pertenecientes al podcast ni al fotolog. Temas variados correspondientes a las inquietudes que me surgen en el día a día: tecnología informática Linux, Windows y MacOS; de dispositivos Android, iOS y Raspbian; sobre el estilo de vida fitness; algo de Ciencia, incluyendo referencias a mi blogdelaboratorio.com; viajes y opiniones varias que sirven en ocasiones para hacer terapia y otras para mostrar incoherencias.

El enjambre bacteriano

Con el fin de desarrollar el proceso infeccioso, muchas bacterias patógenas se mueven colectivamente a lo largo de la superficie del órgano a infectar convirtiéndose en una colonia masiva, y en consecuencia producen toxinas y sustancias que dañan los tejidos del huésped. Este movimiento es conocido como enjambre, similar al movimiento de las colonias de abejas y otros animales. Las partes del proceso molecular que tienen lugar durante este movimiento ya se han descrito, pero el mecanismo que controla la activación o la inhibición no se conoce aún.
La investigación desarrollada en la Universidad Autónoma de Barcelona revela por primera vez la relación entre el sistema de reparación del ADN bacteriano, conocida como la respuesta SOS, y la salida en enjambre. Los investigadores demostraron que la presencia de antibióticos activa la respuesta SOS y por lo tanto aumenta la concentración de la proteína RecA. Esto interfiere con la acción de la proteína Chew, esenciales para la salida en enjambre, y por lo tanto hace que la colonia bacteriana detenga el movimiento. Cuando la concentración de este antibiótico disminuye, la cantidad de proteína RecA se reduce y Chew, una vez más, puede continuar su tarea de propagación de la bacteria.
Los resultados obtenidos indican que dadas las características especiales de este tipo de movimiento colectivo, los antibióticos sólo afectan a las células externas de la nube, que a su vez, actúan como sensores y activan el mencionado sistema de reparación molecular. Esta acción anula el efecto de la droga en el resto de la población de bacterias.
Jordi Barbé, Laura Medina Ruiz y Susana Campoy, los investigadores del Departamento de la UAB de Genética y de Microbiología y directores del estudio, destacan la importancia de este descubrimiento que permitirá el diseño de objetivos de bloqueo de la acción de RecA y así aumentar la sensibilidad a antibióticos por parte de las bacterias .
La investigación fue llevada a cabo en Salmonella enterica, miembro de un grupo de bacterias que se encuentran en varias especies de patógenos causantes de enfermedades en el aparato digestivo y respiratorio, como la septicemia e infecciones sistémicas.

Fuente: Universidad Autónoma de Barcelona

Flower power y la lucha por la supervivencia celular

Parece más alguna noticia hippie que científica, pero el título va perfecto. En un principio cuando leí el artículo científico creía que se trataba de alguna proteína que tenía que ver con la interacción con el mundo vegetal. Pero tan sólo se trata de la tremenda elocuencia a la hora de asignar nombres. Lo bueno es que es un trabajo Made in Spain, así que les perdonamos porque forma parte de nuestra cultura pizpireta. jeje.
Durante el desarrollo, una célula compara sus tasas metabólicas con las células vecinas y, como resultado, las células que mejor se adapten “ganan” y proliferan a expensas de las vecinas que “pierden” y son eliminadas. Este proceso de competición celular fue descrito por primera vez en la mosca de la fruta, en las estructuras llamadas discos marginales de las larvas que dan origen a las partes del cuerpo adulto, como las alas. La competencia puede servir como una forma de garantizar que sólo las células más aptas contribuyen al organismo en crecimiento. Sin embargo, todos los reguladores de dicha competencia conocidos también son conocidos por afectar el crecimiento celular y la supervivencia en general, por lo que ha sido difícil determinar qué animales resultan beneficiados de este tipo particular de “batalla cuerpo a cuerpo” celular.
“Estábamos interesados en la investigación de cómo las células de la mosca de la fruta distinguen entre ganadores y perdedores durante la competición celular”, explica el autor principal del estudio, el Dr. Eduardo Moreno del Centro Nacional del Cáncer en Madrid. “Tomamos un enfoque genómico y lo combinamos con ensayos funcionales con el fin de identificar genes expresados durante el comienzo de la competición celular.”
El equipo del Dr. Moreno ha identificado varios factores involucrados en el proceso, incluyendo la Flower (flor), una proteína que se encuentra en la membrana celular de los animales multicelulares. Parece ser que hay tres diferentes isoformas de esta proteína en el transcurso de la competición que etiquetan a las células. Una etiqueta específica de esta proteína Flower no sólo marca a las células como perdedores sino que dispara su eliminación por apoptosis (muerte celular programada genéticamente). De hecho, la Flower es necesaria para la competencia de células que se produzca, pero no afecta el crecimiento celular y la supervivencia general.
“En conjunto, nuestros resultados sugieren que las isoformas Flower genernr el andamiaje que se requiere y es suficiente para marcar a las células como las ganadoras y perdedoras en las interacciones competitivas entre las células”, concluye el doctor Moreno. “El código extracelular compuesto por las isoformas Flower puede tener implicaciones biomédicas más allá de la competencia porque los desequilibrios de la salud física de la célula también aparecen durante el envejecimiento, en la formación del cáncer y en la metástasis”. De hecho, el papel específico de la Flor en la competencia de las células hace que sea un enfoque único para el estudio futuro en la comprensión de la función de la competencia celular de forma aislada de otras señales como el crecimiento de un tejido de control. Un ejemplo más de la tremenda ayuda de los estudios genéticos de animales inferiores para nuestro beneficio.
Este artículo no es tan sencillo de comprender, pero si tenéis alguna duda en la terminología no dudéis en comentar. Espero que os haya gustado

Referencia: Rhiner et al.: “Flower Forms an Extracellular Code that Reveals the Fitness of a Cell to its Neighbors in Drosophila.” Publishing in Developmental Cell 18, 985-998, June 15, 2010.

De vuelta y potenciando la inteligencia

Después de un par de semanas de relax, vuelve el blog de laboratorio a estar operativo. Para comenzar a engrasar un poco las oxidadas teclas, os cito directamente un artículo que me ha llegado por correo sobre la interacción de ciertos microorganismos que pueden mejorar la inteligencia. Sin más preámbulos os dejo el artículo y el enlace de la fuente de dicha información. Cada día la naturaleza me deja más perplejo.

Un equipo de investigadores a cargo de la profesora Dorothy Matthews de The Sage Colleges de Troy, Nueva York, realizó un estudio donde pusieron en evidencia que los animales que estuvieron en contacto con la bacteria Mycobacterium vaccae demostraron una mejor capacidad para aprender nuevas tareas y niveles más altos de serotonina (compuesto químico cerebral asociado al estado de ánimo). Según la investigadora, M. vaccae es una bacteria que vive en la tierra y es muy posible que las personas la ingieran o la respiren cuando conviven un tiempo en contacto con la naturaleza. En investigaciones previas, se pudo demostrar que la bacteria en cuestión estimulaba en ratones el crecimiento de neuronas, lo que ocasiona una mejora en los niveles de serotonina y una reducción de la ansiedad. Se cree que la serotonina podría tener un papel en los procesos de aprendizaje. Es por esa razón que los científicos decidieron realizar una investigación para ver si la bacteria Mycobacterium vaccae podría mejorar la inteligencia. Mathews y su equipo realizaron una serie de ensayos con dos grupos de ratones, basándose en ésta hipótesis. Al primer grupo se le ofreció la M. vaccae viva, mientras que al segundo grupo se lo mantuvo aislado del patógeno. Luego se colocaron a los ratones en un laberinto y pudieron ver que los ratones del primer grupo (los alimentados con la bacteria viva) atravesaron el laberinto el doble más rápido y de manera más tranquila que los ratones del segundo grupo. En un segundo ensayo con los mismos ratones, a los que se les había alimentado con la bacteria viva esta vez no se les ofreció, y se pudo ver que aunque los ratones corrieran más despacio que la primera vez, aún así pudieron superar a los ratones que estuvieron aislados del patógeno. "Creemos que estos resultados son importantes porque sugieren una relación entre los microbios y la función cerebral", indicó la profesora Matthews. La experta manifestó que se podría decir que pasar tiempo en contacto con la naturaleza, donde se encuentra la M. vaccae sería positivo para los seres vivos. La investigación fue presentada durante la conferencia anual de la Sociedad Estadounidense de Microbiología realizada en San Diego, California.

Fuente: Argos portal de veterinaria

La Biblioteca Digital Mundial

Ya hace más de un año que está en funcionamiento, pero ahora que va tomando forma poco a poco la quería comentar en el blog. La Biblioteca Digital Mundial comenzó su andadura sobre Abril del año pasado y poco a poco va aumentando en volumen. Incluye agrupaciones geográficas interactivas, un cronograma, visualización de imágenes avanzada y capacidades interpretativas. Las herramientas de navegación y las descripciones de contenidos están disponibles en árabe, chino, inglés, francés, portugués, ruso y español. Los libros, manuscritos, mapas, fotografías y otros materiales fundamentales representan una variedad más amplia de idiomas, ya que se ofrecen en sus idiomas originales.
La navegación por la web es sencilla, con un menú en la parte superior que muestra la posibilidad de elegir entre lugar, tiempo, tipo de artículo o institución como categorías. La verdad es que es divertido observar lo que ha sucedido desde una línea temporal que comienza 8000 años antes de Cristo.
La Biblioteca Digital Mundial fue desarrollada por un equipo de la Biblioteca del Congreso de los EE.UU., con colaboraciones de instituciones asociadas de muchos países; el apoyo de la Organización de las Naciones Unidas para la Educación, las Ciencias y la Cultura (UNESCO); y el apoyo financiero de varias empresas y fundaciones privadas (entre los que se encuentran todopoderosos conocidos como Google o Apple). Además se puede ver, en este listado, los socios, entre los que se incluyen las bibliotecas de las Universidades de Yale y Carolina del Sur, la Biblioteca de Alejandría, la Biblioteca Británica o, también por cercanía, la Biblioteca Nacional de España.
Es un lugar genial para navegar donde se pueden ver mapas antiguos o manuscritos como si estuvieran en la mano. Todo buen investigador debe tener en cuenta este material que pertenece a todos.

Enlace a la Biblioteca Digital Mundial

Expresiones de dolor en ratones

Cuando alguien sufre de dolor, rápidamente nos damos cuenta por las expresiones, muecas miradas..etc. Pero, ¿se podría ver la cara de dolor en especies de animales que no fueran humanos?. Pues esto es lo que han tratado de estudiar un grupo de investigadores tomando como “paciente” al incansable, y siempre presente en ciencia, ratón de laboratorio. Inyectaron ciertas sustancias inflamatorias que les produjeron un dolor de cabeza. Luego, grabaron en vídeo las muecas y fueron analizadas por descodificadores faciales de expresión. De esta forma anotaron cinco expresiones distintas ante el dolor.
A primera vista, todo parece una excusa para torturas a los animales, pero este estudio pionero puede ayudar en un futuro en el diagnóstico de enfermedades en seres humanos.
Podéis escuchar el podcast en inglés sobre el tema AQUÍ.

Fuente: Nature Methods

http://www.scientificamerican.com/podcast/podcast.mp3?e_id=8E2F33ED-B1F3-42D6-8603C4188C49E804

Podcast: Reproducir en una nueva ventana | Descargar

Genes microbianos mejoran el crecimiento vegetal

Bacterias en el interior de la planta — Bacterias en el interior de una planta

Se podría pensar que las bacterias que invaden los árboles están ahí para provocar una destrucción segura. Pero al igual que las “bacterias útiles” que viven dentro de nuestras entrañas, algunos microbios ayudan a las plantas para que prosperen. Para saber lo que sucede en estas interacciones microbio-planta, los científicos del Departamento de Energía de EE.UU. (DOE) del Laboratorio Nacional Brookhaven han descifrado el genoma de un microbio que vive en una planta el cuál podría aumentar hasta un 40% crecimiento de la misma. Sus estudios, que se describen en PLoS Genetics, identificaron una amplia gama de genes que contribuyen a explicar esta historia de simbiosis. El trabajo podía mover el enfoque de la utilización de bacterias como agentes potenciadores de crecimiento un poco más a la aplicación de mejoras en la agricultura y la producción de biocombustibles.
Los biocombustibles derivados de plantas son una fuente atractiva de energía alternativas, pero muchos de los cultivos que son materia prima para biocombustibles están en competencia directa por los recursos agrícolas con los cultivos destinados para alimentos, tales como tierra, agua y fertilizantes. La investigación está buscando maneras de mejorar el crecimiento de las plantas que son la base para desarrollar biocombustibles en tierras que no se puede utilizar económicamente para la producción de alimentos. También podría utilizarse para aumentar la productividad de los cultivos de alimentos.
El equipo de Brookhaven ha estado estudiando una especie de bacterias aisladas de las raíces de los álamos. “El álamo es una especie de modelo para la producción de biocombustibles, en parte debido a su capacidad de crecer en suelos marginales no aptos para cultivos de alimentos”, dijo el científico Daniel (Niels) van der Lelie, quien dirige el programa de investigación. Los estudios anteriores de los van der Lelie-Taghavi grupo han demostrado que la bacteria Enterobacter (sp 638) aumenta el crecimiento del álamo en hasta un 40 por ciento.
En el estudio actual (a través de la secuenciación del genoma realizado en conjunto Instituto DOE Genoma y los análisis metabólicos realizados en la Universidad de Carolina del Sur) los científicos identificaron un conjunto de genes que ayudan a que Enterobacter (sp 638) se establezca en este nicho. Los estudios también revelaron interacciones entre el microbio y su anfitrión que ayudan a la planta a sobrevivir y prosperar.
Entre los genes bacterianos identificados están los que codifican para proteínas que ayudan al microbio a sobrevivir y competir con otras especies por los recursos en el suelo y a absorber los nutrientes liberados por las raíces de la planta. Los microorganismos también tienen genes que proporcionan beneficios para la planta, incluyendo: genes que pueden ayudar a conferir resistencia a la sequía y la capacidad de coexistir con metales tóxicos, genes que producen antibióticos que protegen a las plantas contra las infecciones de hongos y bacterias, y genes que inducen el crecimiento a las plantas crecimiento como son las fitohormonas, precursores que el álamo no puede producir por sí solo.
Las plantas pueden metabolizar los azúcares que toman del suelo y esto genera unos productos que los utilizan los microorganismos para generar las fitohormonas. Curiosamente, los genes que permiten a las bacterias metabolizar el azúcar y los genes que producen las fitohormonas se encuentran agrupados y asilados del resto, lo que sugiere que pueden haber sido adquiridos conjuntamente por transferencia horizontal.
Los científicos planean continuar su trabajo mediante el estudio de cómo estos genes se expresan durante las diferentes etapas de la colonización bacteriana de los álamos.
Como cabía de esperar, este estudio se basa también en técnicas de PCR cuantitativa para los estudios de expresión. Esperemos que sigan por este buen camino.

Referencia: PLoS Genetics