• Saltar a la navegación principal
  • Saltar al contenido principal
  • Saltar a la barra lateral principal

Raúl de la Puente

el espacio web de @DoctorGenoma

  • Correo electrónico
  • Facebook
  • Instagram
  • LinkedIn
  • Mastodon
  • Twitter
  • YouTube
  • Sobre mí
    • Contacto
  • Blog
    • Ciencia
    • Tecnología
    • Deporte
    • Fotolog
    • La Podcastfera
  • Mis Podcasts

Blog

En el blog encontrarás todas las entradas correspondientes a artículos publicados no pertenecientes al podcast ni al fotolog. Temas variados correspondientes a las inquietudes que me surgen en el día a día: tecnología informática Linux, Windows y MacOS; de dispositivos Android, iOS y Raspbian; sobre el estilo de vida fitness; algo de Ciencia, incluyendo referencias a mi blogdelaboratorio.com; viajes y opiniones varias que sirven en ocasiones para hacer terapia y otras para mostrar incoherencias.

 

Review del sistema Mini-PROTEAN 3 cell de Bio-Rad


Desde hace casi cuatro años me ha tocado lidiar con los geles de poliacrilamida (ver preparación de PAGEs) en multitud de variantes: desde los destinados a secuenciación a los utilizados en aparatos analizadores de fragmentos como el LiCOR 4300, de los sistemas caseros a los sistemas como el Protean II ó este mini-PROTEAN 3. De todas formas, el verdadero factor limitante está en la manipulación de la poliacrilamida y que los sistemas funcionan mejor dependiendo de ciertas condiciones y temperaturas.
En esta ocasión me gustaría hablar de este kit de Bio-Rad. El buen manejo de todo por sus reducidas dimensiones hacen que sea un buen compañero de laboratorio. Una de las grandes faenas es que salga mal la polimerización (aunque con los kits comerciales de polimerización, es bastante raro que falle) y con la consiguiente repetición de todo el proceso de limpieza y montaje. Con este sistema, los dos geles pueden estar corriendo a las 2 horas de haber empezado de cero. Pero de cero de verdad. Desde sacar las cosas de la caja hasta preparar las soluciones necesarias. Eso sí, el reducido tamaño de los geles hace que no estén destinados a análisis de bandas a gran resolución. Pero para probar están bién. Yo he hecho probatinas de técnicas para luego extrapolarlas a geles de dimensiones mayores.
En el montaje, previa limpieza de todos los componentes con etanol, hay que tener cuidado con los cristales. Los que tienen los espaciadores integrados son gruesos, pero las parejas son casi como cartulinas. No se me han llegado a romper ninguno, pero se nota la fragilidad. Os dejo el sistema de montaje para que lo veáis:

Dependiendo de la consistencia de los geles (que la proporcionará la concentración del gel en su mayoría y la calidad de las soluciones empleadas), extraer los geles de los cristales puede ser el paso más crítico por el riesgo de rotura. Siempre se pueden dejar los cristales y embeber el conjunto en las soluciones para teñir (en mi caso he utilizado nitrato de plata y bromuro de etidio como prueba), pero que no pase de la solución de fijación para no tener los cristales “manchados” para futuros geles.
Os muestro un ejemplo de geles teñidos con plata a continuación:

Ejemplo de Geles de poliacrilamida final
Geles de poliacrilamida utilizando el sistema Mini-PROTEAN 3. Pinchar en la imagen para agrandar
Como resumen, las ventajas del sistema son: la rapidez, la manejabilidad en el uso y el buen funcionamiento. Como desventajas: la fragilidad de los cristales, la poca resolución en comparación con sistemas más grandes, el número de pocillos que se originan por los peines que trae de serie y el deterioro que se produce con el paso del tiempo en las zonas de los separadores que originan fugas a la hora de polimerizar (que se pueden siempre solventar con truquitos como agarosa).
Espero que os haya gustado y, si tenéis alguna duda, comentádmela.

Escuchando: Comando Alt Suprimir

Añadir eventos desde Mail a iCal rápidamente

Para este fin de semana quería enseñar una utilidad que muchas veces se pasa por alto a la hora de organizarse. Desde el momento en el que se utiliza un sistema operativo como Mac OS X, las facilidades en las tareas cotidianas aumentan considerablemente. En muchas ocasiones se tiene poco tiempo para estar al día de todo lo que a uno le gustaría. Ciertas reuniones, eventos web o presentaciones pasan de largo por una incorrecta organización. Pero el gestor de correo Mail tiene integrado un reconocimiento de fechas muy útil para estas situaciones. En el momento en el que detecta una fecha (en una gran multitud de formatos e idiomas), da la opción de añadirla como un evento en iCal. iCal es el gestor del calendario y se puede sincronizar con Calendar en la cuenta de Google. He hecho un vídeo muy corto que os muestra cómo reconoce las fechas en varios formatos y en correos provenientes de contactos y países distintos.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=zjGby5zsfn0[/youtube] Luego se puede ver el evento en iCal y, como he añadido en el vídeo, el mensaje puede llegar mediante notificación según el dispositivo y la configuración de cada uno.
Siento la mala calidad del vídeo pero el tiempo apremia. Espero que os haya servido de ayuda.

En busca de agua

No he podido pasar por alto un vídeo que he visto esta semana. Demuestra las estrategias que se tienen que manejar en ciertos lugares del mundo para lograr ciertos recursos naturales básicos como es el agua. El vídeo trata de cómo usar a un mono babuíno para encontrar agua. A esto se llama adaptación y el resto son tonterías. Espero que os guste.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=Umayn7JIgZ4[/youtube]

Escuchando: el termociclador con sus ventiladores que no dan tregua

Biochips y amenazas bioquímicas

Usar biochips ofrece a Daniel Schabacker, del Laboratorio Nacional de Argonne, y sus colegas en la Universidad Loyola en Chicago, la posibilidad de determinar las “firmas” de agentes biológicos que pueden ser usados para actos de bioterrorismo, en especial la bacteria que causa el ántrax (carbunclo), Bacillus anthracis.
Aunque algunos científicos ya han usado análisis de ADN para identificar cepas particulares de la bacteria del ántrax, los biochips son capaces de ayudar de forma decisiva a los científicos y funcionarios gubernamentales a averiguar cómo han sido cultivadas las bacterias del ántrax analizadas, reduciendo así la cantidad de sospechosos potenciales.
Este proyecto, que comenzó hace menos de dos años, sirve como ejemplo del floreciente campo de la ciencia forense microbiana.
En la actualidad, la ciencia forense microbiana es una de las áreas más importantes en el contraterrorismo, y una de las herramientas más decisivas para hacer frente al bioterrorismo. El análisis proteómico que los investigadores del proyecto son capaces de realizar con sus biochips proporciona un conjunto de datos nuevo y diferente sobre agentes biológicos que no podía conseguirse antes. La técnica puede proporcionar a los expertos una “huella dactilar” completa del organismo, una información que los especialistas pueden entonces utilizar para identificar con más precisión el origen de dicho organismo.
Desarrollado originalmente como una herramienta de diagnóstico, el biochip consiste en una matriz de 1 centímetro por 1 centímetro que contiene entre varias docenas y varios cientos de “puntos”, o pequeñas gotas. Cada una de estas gotas contiene un ácido nucleico, anticuerpo o proteína únicos que se asociará a un reactivo particular.
El uso de los llamados microarrays es archiconocido en el mundo científico por su gran reproducibilidad y estandarización. Pero dependiendo de lo que se estudie, estos chips pueden ser “caseros” por su elevado coste.
Espero que os haya gustado.

Más información: Sci-Tech news

Escuchando: a mi reloj biológico, que sigue igual que hace 10 años…o mejor XDD.

Protocolo para geles de Poliacrilamida

Desde hace unos años estoy utilizando protocolos varios para resolver ciertos marcadores moleculares en geles de poliacrilamida. Por falta de tiempo, no he podido nunca poder hacer un vídeo explicativo para que todos vosotros pudierais ver el trabajo que se origina para este tipo de análisis. Pues he encontrado a un grupo de investigadores hindúes, que se han trabajado esos vídeos y me van a permitir mostrar los pasos básicos que se siguen. Os cuelgo dos vídeos que muestran el proceso completo a seguir. Siempre hay variaciones en cada laboratorio, como los equipos a utilizar o las disoluciones, pero en esencia esta bien explicado. Lo más curioso es el inglés-hindú. Me recuerda a Raj, uno de los protagonistas de The Big Bang Theory.
Parte 1.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=qCTc_jTMqJo[/youtube] Parte 2.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=vfIYE47Ha0E[/youtube]

Espero que sirva de ayuda a alguna mente inquieta. Si tenéis alguna duda, comentádmela.

Escuchando: Gravina 82 episodio 25.

Fitness en casa

De nuevo Youtube vuelve a dar sorpresas. En este caso me ha permitido conocer a CharlieJames1975, que es así como se da a conocer en su canal de Youtube. Es una chica que parece que se dedica al mundo del fitness y que tiene una web, BodyRock.tv, muy completa sobre el tema de la tonificación, pero orientado a seguirlos en casa o al aire libre. Lo mejor de todo es que los entrenamientos que sugiere son vídeos. Lo malo para algunos, que están en inglés. Pero no importa porque más vale una imagen que mil palabras.
Os dejo colgado un vídeo sobre un entrenamiento sobre una serie de ejercicios que permiten quemar calorías de una forma rápida. Como veréis, en cada vídeo hace una introducción sobre lo que se va a practicar y, como no tiene un inglés muy difícil de entender, es fácil de seguir las instrucciones.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=kNuW5yDaxTY[/youtube]

En su web se encuentran detallados tanto los entrenamientos como consejos e información al respecto.
Bueno, a practicar un poco de ejercicio para enseñar palmito, que se huele va a ser un verano caluroso de nuevo. Espero que os haya gustado.

Escuchando: Kafelog 77

  • « Ir a la página anterior
  • Página 1
  • Páginas intermedias omitidas …
  • Página 201
  • Página 202
  • Página 203
  • Página 204
  • Página 205
  • Páginas intermedias omitidas …
  • Página 254
  • Ir a la página siguiente »

Barra lateral principal

Premio Innova

PERFIL DE MASTODON

Comentarios recientes

  • Raúl de la Puente en Palabros de cine: plot twist
  • Alex PSUCM en Palabros de cine: plot twist
  • Más allá de un coronavirus, el SARS-CoV-2 y la COVID-19 - Raúl de la Puente en Un Papá en Apuros 102: Día 18 de cuarentena- El tema de las mascarillas
  • Radioyentes 101 Marconi audio online y apps - Radioyentes en El Interpodcast 2019 está a punto de comenzar
  • Radiotweets 16-09-2019 - Radioyentes en Todo sobre Podcast Days 2019

Archivos

Follow me on ResearchGate Safe Creative #1209050059498

Raúl de la Puente - Derechos reservados© 2026 · Acceder

Utilizamos cookies propias y de terceros para garantizar el funcionamiento de la web, medir su uso y mejorar nuestros servicios. Puede aceptar todas las cookies, rechazar las no necesarias o configurar sus preferencias. Política de cookies

Configurar cookies

Necesarias para que la web funcione correctamente. No se pueden desactivar desde este panel.

Ayudan a medir el uso del sitio y mejorar sus contenidos.

Permiten publicidad, medición de campañas o personalización de anuncios.

Guardan preferencias o permiten contenido externo no necesario.