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En el blog encontrarás todas las entradas correspondientes a artículos publicados no pertenecientes al podcast ni al fotolog. Temas variados correspondientes a las inquietudes que me surgen en el día a día: tecnología informática Linux, Windows y MacOS; de dispositivos Android, iOS y Raspbian; sobre el estilo de vida fitness; algo de Ciencia, incluyendo referencias a mi blogdelaboratorio.com; viajes y opiniones varias que sirven en ocasiones para hacer terapia y otras para mostrar incoherencias.

La gingivitis no es sólo problema del cepillo de dientes

Desde pequeños la limpieza de los dientes ha sido algo que nos ha preocupado bastante. Sobre todo a la hora de irse a la cama y saber que no se han dejado las perlitas de la boca como los chorros del oro. La gingivitis es una de las enfermedades infecciosas bucales más comunes. En Estados Unidos más de la mitad de la población ad ulta sufre esta inflamación y s angrado de las encías. No olvidemos que es producida por una infección bacteriana producida por la falta de higiene bucal. Sí: hay que lavarse los dientes, porque se sabe que puede originarse con tan sólo 3 días sin sanear la boca.
Después de un pequeño repaso de la enfermedad, lo curioso es que se ha realizado un estudio en la Universidad de Carolina del Norte (Estados Unidos) para desentrañar los posibles mecanismos moleculares que se esconden tras este mal. Se ha realizado una búsqueda exhaustiva mediante la tecnología de Chips de ADN conjugados con importantes desarrollos bioinformáticos, y los datos de expresión obtenidos demuestran que alrededor de 9000 genes intervienen en el desarrollo de la enfermedad. Estamos hablando de un 30% de los genes humanos. No es de extrañar ya que es una infección y, por lo tanto, se desencadenan cascadas de procesos bioquímicos en masa para combatirla: respuesta inmune, metabolismo energético, procesos neuronales y vasculares…etc. Según los investigadores, será posible analizar esos genes que sean decisivos para el desarrollo de la enfermedad y tratarla de forma dirigida.
Los odontólogos ya pueden quitarse un poco del peso de encima y pasárselo a la ciencia. A ver si entre todos conseguimos sonrisas “profident”.

Fuente: The University of North Carolina

El cuaderno de laboratorio

Vamos a comentar un poco sobre el compañero inseparable del investigador: el cuaderno de laboratorio. Todo lo que se realice en el laboratorio tiene que estar bien documentado: las tareas, los resultados (buenos y malos), las ideas, protocolos…etc., y para ello está el cuaderno. A la hora de entrar en el laboratorio es lo primero que tocas y será lo último que veas cuando se sale por la puerta. Es como un gestor GTD rudimentario pero con las funciones bien definidas. Existen programas que permiten llevar las tareas del laboratorio (incluso apuntando los períodos de tiempo), pero originan más una pérdida de tiempo que una ayuda porque se necesita estar más pegado al monitor que otra cosa. Por si los maqueros quieren probar alguno, pueden pasarse por la sección de aplicaciones. Allí comento el Lab Assistant, que se puede sacar un buen partido ya que genera logs en los que se pueden incluir las imágenes que se deseen.
Dependiendo de lo que se haga y dónde se tenga el cuaderno, puede ser de un tipo u otro. Se pueden tener cuadernos de las tareas y protocolos en el laboratorio donde se “cocinen” los experimentos y luego se puede tener otro mejor ordenado donde se expongan los resultados. Yo tengo las dos cosas en el mismo ya que en el laboratorio en el que me encuentro puedo organizarlo así. Lo que tiene que tener ese bloc es orden. Orden y limpieza. La mayoría de las veces sirve para presentar los resultados y hazañas obtenidas a los directores del proyecto de investigación por lo que es muy buena idea que la imagen sea buena: las fotos bien etiquetadas, protocolos fáciles de seguir, letra legible y evitando manchurrones que enpobrezcan lo realizado entre micropipetas.
A medida que se va avanzando en el proyecto lo más seguro es que se deba tener más de 2 cuadernos. Es recomendable etiquetarlos para que no se pierdan, ya que el que se usa siempre se tiene a mano pero el resto hay ocasiones en las que se les pierde la vista (como por ejemplo al prestárselo a alguien que le interese lo que haces). En nuestro laboratorio se suele dar últimamente cuadernos que permiten arrancar las hojas y éstas ya están perforadas para archivarlas. Así tengo yo mis tomos científicos cuasi enciclopédicos XDD.
Cuando se empieza un proyecto de investigación recomiendo que el cuaderno plasme todo lo que se realiza, detallando las fechas y todos los males que puedan ocurrir. Ah!, un pequeño truco: como en la mayoría de las ocasiones se hacen chuletas para hacer algunos protocolos y luego se posa el cuaderno en cualquier sitio con peligro de derrame de sustancias líquidas, el uso del lápiz o portaminas es indispensable. Así se evitan ciertas manchas que hacen ilegibles los resultados. Aunque lo mejor es hacer chuletas separadas, claro.

A modo de curiosidad, existen marcas que fabrican cuadernitos para laboratorios. Os muestro uno en la imagen lateral. Y si queréis echar un vistazo, en este enlace se muestra un amplio catálogo de cuaderno para todo tipo de tareas. Yo por ahora me quedo con los de toda la vida.

Mapa del genoma del oso panda gigante

Investigadores del Instituto de Genomica de Pekín han terminado por secuenciar y mapear el genoma del panda gigante. Lo curioso, a parte del estudio intensivo de este animal en peligro de extinción, es que la comparación realizada con otros genomas de las bases de datos ha demostrado su similitud con el perro.
El oso panda gigante posee 21 pares de cromosomas conteniendo en ellos alrededor de 20.000 genes. Gracias a este estudio se podrá intentar encontrar las causas de la poca capacidad reproductiva si ésta se produce por una consecuencia de expresión génica. A ver si se salvan al final estos animalicos.

Fuente: Beijing Genomics Institute

Gmail: el gran aliado del investigador

Nunca pensé que iba a tener todo lo que necesito en el trabajo en cualquier lugar del mundo y que no tuviera que pagar por ello. Mucha gente comenta que estamos «cogidos por los huevos» por Google. No lo niego. Cualquier persona del mundo le preguntas cuál es su página de inicio y te va a responder como un pavo: google. Sin embargo poca gente sabe todo lo que ofrece esta empresa. En primer lugar, tienes el simple correo Gmail. Lo esencial. Para crear una cuenta en condiciones con Google, se debe registrar en este servicio. Cuando se tiene la cuenta de correo se accede al escritorio donde se ven el resto de aplicaciones.

Gmail gestiona directamente los contactos como cualquier otro proveedor de correo electrónico. Pero lo primero que impresiona es una cosa: hay 7,5 Gb de espacio en el buzón. Hace 10 años casi no había discos duros con esa capacidad y ahora nos la da un servicio por hacer un par de clics. Tiene directamente asociado un chat para que no se tenga que cambiar de ventana o aplicación para entablar una conversación. Los filtros de correos recibidos son muy configurables. Y se puede dirigir los correos de otras cuentas y de otros proveedores y enviar los mensajes utilizando ese buzón de Gmail pero pudiendo responder con la dirección que se desee. Y, como no, la posibilidad de configurarlo todo con cualquier gestor de correo y agenda. Pero Gmail es sólo lo básico. Lo siguiente que ofrecen gratuítamente es Calendar: el gestor de calendarios y tareas. Que es compatible por ejemplo con iCal y Outlook. Y si se quiere que Google te avise por sms de algún evento de la agenda, pues también es posible y gratuíto. No se tiene que sincronizar un móvil con ninguna aplicación de calendarios para recordar todos los eventos. Es posible configurarlos todos por sms y recibir los avisos en cualquier dispositivo.
Reader es otra de las herramientas que más deberían usar los investigadores. Mediante Reader se pueden seguir todos los rss para estar al día de las publicaciones y noticias referentes a la ciencia. Sin depender de las suscripciones guardadas en el portátil u ordenador de cada uno. Donde se quiera se puede acceder a la aplicación en la web y revisar los artículos.
Pasamos a Google Docs. Imaginad que estáis en un ordenador ajeno y que necesitais escribir una carta pero que no hay instalada aplicación alguna de ofimática. Pues mediante GDocs se pueden crear esos documentos y guardarlos para el momento que se quiera. Yo todavía no he tenido la oportunidad, pero ya me he visto en situaciones parecidas en ciertos hoteles que tienen ordenadores a disposición de los clientes pero que tan sólo tienen lo necesario para navegar por internet. Pues con esto está todo solucionado. Y si encima se tiene acceso a infinidad de publicaciones y que se pueden gestionar mediante su interfaz…pues, como dicen los del sur, «de lujo».
Esto que he contado es lo básico. Pero hay más cosas como Orkut (red social de google), Gtalk (chat de Google), Blogger (servicio de creación de blogs), Feedburner (administrador de los feeds de páginas web, que sirve para gestionar las sindicaciones), por no hablar de Maps (para guardar y observar rutas) o la nueva y muy verde aún Google Wave (un nuevo interfaz en el que se quiere orientar el correo al mundo empresarial en el que varias personas pueden seguir un mismo wave y opinar o escribir sobre ello desde cualquier lugar) pero que se necesita de invitación para acceder teniendo cuenta de Gmail.
Hay más cosas por ver en este mundo Google, pero yo lo veo genial y muy útil mientras que la gran mayoría de la gente que conozco se queda con los ojos abiertos y lo primero que me dice es: «¡Qué friki que eres!». No me molesta la palabra sino la falta de información y desperdicio de una de las herramientas más potentes que existen. Probádlo los que aún no lo hayáis catado y ya me contaréis.

Clonación

El tema de la clonación lleva directamente a debate si se saca del mundo científico. En el momento en que se dice esa palabra por la calle, saltan las alarmas y empiezan a preguntar que si se está a favor o en contra. Dejemos de pensar que la clonación es sinónimo de hacer clones humanos. Ya vale. Vamos a situarnos un poco. Clonar significa obtener individuos genéticamente idénticos. Con la misma información genética. Pero la clonación se realiza todos los días en casi todos los laboratorios en los que se trabaje con material genético. Y no hay debate. La clonación se utiliza para poder obtener copias idénticas de un fragmento de ADN que se introducen en bacterias (previamente preparadas para ello) y así generar un gran número de ellas para el análisis del conocido ácido desoxirribonucleico. Pero, claro, se pasa de hablar directamente a la obtención de individuos animales (los humanos seguimos perteneciendo a ese gran Filo Animalia) genéticamente idénticos mediante técnicas de reproducción asistida e in vitro y no se informa de lo que es útil y lo que no. La clonación es útil para regeneración tisular, cura de patologías, implantes…etc. No para «crear» seres idénticos. Vale que si se tuvieran individuos idénticos se podría usar los órganos de uno para transplantárselos al otro, pero eso es más de película y si no que se lo digan a Ewan Mcgregor y Scarlett Johansson.
Repasando, un clon es un individuo con la misma información genética que otro. Por lo tanto una célula es clon de otra que tenga el mismo material hereditario. Y ya está. Dirijamos nuestra atención y los dineros para investigar cosas útiles y no comerciales. Porque al fin y al cabo todo lo que rodea a las clonaciones de mamíferos y humanos es marketing y prensa que mal informa a la gran mayoría de la población.

La importancia de la educación física

El lema “Mens sana in corpore sano” creo que es algo esencial. Desde pequeños se intenta que los niños realicen actividades físicas para su mejor desarrollo. Pero estamos ahora ante una sociedad que tira más por el “sillónball” y hacer clic con el ratón. La motivación para el deporte es básica y aquí es donde entra el profesor de educación física. Se ha realizado un estudio con un total de 779 estudiantes entre chicos y chicas de 12 a 16 años que demuestra que esas clases dentro del horario escolar pueden influir bastante a la hora de motivar al estudiante a hacer deporte fuera del colegio o instituto. La enseñanza del profesorado debe centrarse en el esfuerzo y superación personal y no tanto en la comparación entre los alumnos para que alcancen lo que llaman “flow disposicional” que no es mas que un estado psicológico óptimo que permite a las personas afrontar una tarea con las mejores condiciones psíquicas posibles y que es la causa del disfrute al realizar las actividades físicas. También se observa mediante este estudio que los individuos que realizan actividades deportivas fuera del horario escolar tienen una mejor motivación en el desarrollo de las clases de educación física, mostrando un buen “flow disposicional”.
A mi me encanta el deporte desde que tenía pañales y los profesores por los que he pasado no es que fueran unas figuras (la gran mayoría no creo que supieran hacer el pino con 4 apoyos XD), pero sí que es verdad que se queda en la memoria ese educador que motiva a superarte. Y ahora lo tienen más difícil que nunca. Los estudios de investigación como este ayudan a afianzar de forma empírica lo que ya se suponía.

Referencias: David González-Cutre, Álvaro Sicilia, Juan Antonio Moreno y Juan Miguel Fernández-Balboa. “Dispositional Flow in Physical Education: Relationships With Motivational Climate, Social Goals, and Perceived Competence”. 2009. Journal of Teaching in Physical Education, 28, 422-440.