Los polimorfismos de un único nucleótido (Single Nucleotide Polimorphism=SNP) son una de las variaciones más estudiadas en todos los genomas y, especialmente, en humanos. Estos SNPs (se lee esnips) no son más que variaciones de una sola base de la secuencia de ADN. Ahora también se consideran SNPs a unos cuantos nucleótidos que varían, como también pequeñas inserciones y deleciones pueden ser consideradas como SNP. 
Quería compartir una base de datos muy importante en este campo: la SNPedia. Consta de un catálogo de los SNPs que se van descubriendo y secuenciando. Incluso están clasificándolos por genomas utilizados, genes involucrados y también medicinas que actúan mejor o peor dependiendo de tener o no estas variaciones.
Os dejo este enlace para la SNPedia y otro para su blog, donde actualmente han publicado los 10 SNPs más relevantes del pasado año. Me encantan estas cosas.
Blog
En el blog encontrarás todas las entradas correspondientes a artículos publicados no pertenecientes al podcast ni al fotolog. Temas variados correspondientes a las inquietudes que me surgen en el día a día: tecnología informática Linux, Windows y MacOS; de dispositivos Android, iOS y Raspbian; sobre el estilo de vida fitness; algo de Ciencia, incluyendo referencias a mi blogdelaboratorio.com; viajes y opiniones varias que sirven en ocasiones para hacer terapia y otras para mostrar incoherencias.
Dietas y Spinning en Irrecomendando
La vuelta de las vacaciones hace estragos en la mayoría de la gente. Y no sólo por el factor monetario, sino también en el físico. Las ganas de perder unos kilitos siempre encaminan a dietas fugaces y pastillas que tienen como única función robar el dinero de la gente. Siempre he comentado lo importante que es llevar un conteo de lo que se toma. En musculación todo es más estricto pero, para perder los kilos que se han ganado en las navidades, no habría más que seguir las recomendaciones de @irre10 (en Twitter) de este episodio. Y no lo dice un “actor” con bata blanca sentado y bonachón, sino alguien que lo ha experimentado en sus carnes. Al final comenta algo sobre un deporte que todavía no he tenido el gusto de practicar, el spinning, pero que con lo que me gusta la bicicleta de montaña y sudar no habrá más que proponérselo. Si os queréis suscribir al podcast, podéis hacerlo desde mi sección “ocio” de podcasting.
Enlace al episodio
La inversión del Instituto de Genómica de Pekín

Os dejo a continuación el mapa que localiza los sistemas de secuenciación en todo el mundo. Algo se está cociendo en China.
Fuente: PolITigenomics
Nuevo secuenciador: HiSeq 2000

La interfaz con el usuario también ha sido mejorada, pudiendo introducir datos mediante teclado o también gracias a la pantalla táctil.
Los precios de los que se hablan es de 650.000$ por el secuenciador y 10.000$ por los componentes y todo lo necesario para su funcionamiento. Lo bueno es que parece que hay cierta subvención a los propietarios de los aparatos Illumina anteriores a este.
Todavía no se habían instaurado los “antiguos” secuenciadores y ya hay más novedades. Y lo mejor creo que está por llegar en breve.
Fuente: Pathogenomics
El Gran Colisionador de Hadrones
Las preguntas sobre qué se hace en el CERN de Ginebra (La Organización Europea para la Investigación Nuclear. Tienen una cuenta en Twitter muy curiosa @cern) desde que se polemizó sobre el tema del fin del mundo han aumentado. El desconocimiento sobre la materia es lo que me ha llevado a exponer esta entrada en el blog. Después de escuchar el último episodio del podcast de la Buhardilla 2.0, me ha hecho recordar en una duda que tuvo un compañero de trabajo de mi padre hace varios años: ¿qué se hace en el CERN?. Pues qué mejor que ver un vídeo explicativo sobre el tema del Colisionador de Hadrones para despejar dudas. Hay que agradecer a AZURA888 la realización del vídeo. La voz en off deja que desear, pero por lo menos alguien se ha dignado en traducirla y colgarlo en español. Aquí os lo dejo:
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=T79nNX_5Pi0[/youtube]
Mis imprescindibles en Android
Después de trastear unos mesecitos con mi HTC Magic y experimentar con él durante las vacaciones, me voy a permitir comentar las aplicaciones que son imprescindibles por ahora y por qué. Me han permitido administrar mejor mi tiempo, que en el laboratorio lo tengo gustito. Tengo que remarcar que la versión de Android que utilizo es la 1.6 (Donut) y que es la original de Vodafone. No se ha habilitado acceso root (todaviaaa :-D). Aquí van:
–Astro: el gestor de archivos gratis que mejor va para navegar por la tarjeta SD. Además permite hacer un backup de los datos.
–Toogle settings: es un gestor similar al locale. Lo malo de este último es que tiraba bastante de memoria y la Magic no es que brille por su ram. De todas formas Toggle settings permite crear perfiles y modificar fácilmente las opciones de configuración. Lo que ha mejorado es el administrador de tareas, que ofrece cerrar las que no nos interesa e incluso nos informa de todas las que corren en background. Ha hecho que desinstale task killer.
–Aldiko: lector de libros electrónicos. Los lee en el formato epub, al cuál se pueden pasar de otros formatos como pdf con aplicaciones como Calibre en Mac. La interfaz y navegación, un 10.
–Twidroid: en la versión pro se consiguen algunas mejoras como manejar varias cuentas o personalizar la interfaz. La versión gratuita es similar a otras como Swift o Seesmic, pero creo que me he acostumbrado a Twidroid. De todas formas el testeo comparativo con otros clientes de twitter no ha sido intensivo, puesto que casi nunca lo tengo corriendo todo el tiempo.
–aCast: gestor y administrador de podcasts. A los fanáticos del podcasting como yo necesitamos estas aplicaciones como la radio a otras personas. Es gratuíta con versión de pago disponible.
–WPtogo y AndroBlogger: son gestores de cuentas de wordpress y blogger. Para poder colgar nuevos post a tus blogs con enlaces o imágenes. Y además permiten añadir etiquetas y categorías. Un poco lentos y consumen algo de recursos. Gratuítos los dos.
–Better keyboard: es una opción de pago, pero añade una mejor interfaz al teclado que viene de serie. He notado algo de retardo cuando se utiliza en navegadores. Con los mensajes va completamente fluído. ¿Será por algo llamado RAM?
–mAnalytics: si se quiere estar al tanto de las visitas a tus sitios web mediante la cuenta de Google Analytics, esta aplicación es genial. Además, se puede ver esa información en tiempo real. Gran fallo de los informes de Google, que tienes que esperar al fin del día.
–NewsRob: lector de feeds. Ya se que muchos prefieren directamente el lector de Google Reader de la versión móvil corriendo en el navegador, pero se olvidan de un detalle: la posibilidad de leer los artículos off line. Esto hace que en zonas de poca cobertura 3G se puedan leer todos los que se hayan guardado en memoria, que dependerá del tiempo que se configuren sus actualizaciones.
–Doit.im: es un gestor GTD. Pero, además de ser un servicio gratuíto, permite integrar tus tareas en un calendario nuevo en Calendar de Google. Y gestionarlo de igual forma. A Evernote ya le pisa los talones.
–APNdroid: para mí el más imprescindible de todos. El gran salvador de la batería en momentos clave. Y eso es secundario. Es una aplicación que permite desconectar todos los servicios 3G para que no haya sincronizaciones ni conexiones a internet. Pero se puede configurar para permitir mensajes multimedia (MMS). Esto es necesario cuando se viaja por el tema del roaming, pero la segunda utilidad es la del ahorro de la batería: lo que más pilas gasta es el trasiego de datos con el 3G activado. Además, en las nuevas versiones incluye el widget para el escritorio. Recemos para que no pidan euros por él.
–Bluetooth file transfer: antes se necesitaba ser root para poder pasar archivos por bluetooth. Con esta aplicación ya no es necesario. Se enlazan los dispositivos y se puede mandar lo que sea a otro dispositivo. Es una pena que mi Macbook sea reacio a hacer migas con la Magic.
–Juegos: yo no soy de tirar de juegos, pero se han quedado instalados para deleite de terceros Frozen bubble (como el Puzzle Bubble), PapiJump (igual que el Abduction, bolita saltando conducida por el acelerómetro por plataformas), Gensoid y Snesoid (emuladores para juegos de la Mega Drive y Super Nintendo), CopyCat (el antiguo Simon)…
–Handcent SMS: es un gestor de mensajería. Mejora la interfaz y está en español (fallo de Chop SMS). Permite instalar skins para su mayor configuración.
–FX camera: muchos que venimos de los Nokia echamos de menos hacer fotos en blanco y negro ó en negativo. Pues estas y otras opciones son las que añade este programa. Y, sí, es gratis.
–Missed Call: permite configurar los recordatorios de las llamadas y mensajes perdidos (incluido los correos) y asignar colores del led a cada tarea.
–NetCounter: es un medidor del tráfico de datos, tanto para la red 3G como para la red wifi. Muy interesante si se tiene un plan de datos sin tarifa plana y combinarlo con al APNdroid.
–Phonalyzr: es una aplicación que nos informa sobre las llamadas y mensajes contando su duración. Para calcular el gasto mensual.
–Places directory: para localizar lugares de interés. Poco a poco va aumentando su base de datos, incluyendo los datos de los sitios buscados. Es rapidísimo.
–Layar: es el típico programa de realidad aumentada. Como en el anterior caso, poco a poco va mejorando. Tira un montón de batería por su conexión de datos, cámara y gps a la vez.
–Car mode: cuando monto en el coche, corro esta aplicación y me olvido de tener que mirar al móvil para contestar. Automáticamente cuando se descuelga se pone en modo manos libres.
–Battery status: la version libre permite ver el tanto por ciento de la capacidad de la batería. He comprobado que no consume recursos y así se puede ver qué aplicaciones chupan más que otras sin tener que esperar a que se vaya consumiendo la barrita de la batería que viene de serie.
–SugarSync: aplicación que permite sincronizar con la nube los datos del móvil. Útil para hacer backups de las fotos. Ha mejorado con creces la transferencia de datos.
–Dolphin browser: navegador web con más opciones que el que viene de serie. Muy similar al firefox. Curioso el sistema gestual de acceder a varias opciones configurables.
–Voice recorder: para grabar las conversaciones. Para cubrirse las espaldas en ciertas situaciones.
–Copilot live: es un navegador GPS. Es de pago, pero merece conseguirlo si no se dispone de un GPS en el coche ya que la pantalla de la Magic es lo suficientemente grande para seguir las instrucciones.
–Wapedia: programa para hacer consultas en la wikipedia. Muy ligero y sus búsquedas son rápidas.
–SMS scheduler: permite programar envíos de mensajes para esas ocasiones en las que se acuerda uno de avisar a alguien justo en el momento que no es y que luego puede olvidarse.
–Ringdroid: recortar y asignar tonos es la misión de esta aplicación.
–Androzip: compresor y descompresor de archivos y carpetas. Necesario para enviar ciertos archivos por correo electrónico.
–Documents to go: para poder ver documentos de word y excel. Con la versión completa de pago permite la edición y se añade la compatibilidad con los pdfs. La verdad es que se convierte en el complemento de ofimática perfecto.
Para mí las aplicaciones más esenciales son las que denominan mi móvil como “with Google”. Estar sincronizado en todo momento está empezando a ser vital. Sobre todo cuando se viaja. Echo de menos un mejor altavoz y una bastante mejorable óptica de la cámara. Por no decir de la pésima calidad de los vídeos. Pero no me quejo. Ahora sólo falta que se invente un tipo de batería que dure el doble por lo menos, porque la red 3G se come la energía.
Todo esto se lo debo a JoaGarcía con su Droidcast y al foro de HTC manía.
Espero que os haya sido útil.