Estas últimas semanas acaban de llegar varios correos a los miembros de la SEG informando sobre estas reuniones. El congreso de Mejora Genética Vegetal se celebrará en Madrid del 7 al 9 de Julio. Para los que estén interesados, ya se han dispuesto en la web alojamientos tipo residencia de estudiantes y también las fechas de interés. Éstas últimas las dejo aquí.
La XV Reunión Nacional de Mejora Genética Animal se celebrará del 16 al 18 de junio de 2010 en Vigo y el plazo para el envío de comunicaciones y el pago de las inscripciones es el 9 de mayo de 2010.
Los enlaces de las webs de cada uno de los eventos os las dejo aquí:
V Congreso de Mejora Genética Vegetal 2010
XV Reunión Nacional de Mejora Genética Animal
Blog
Enzyme X
Como ya anuncié en el último artículo sobre las enzimas de restricción, voy a presentar una aplicación para manejar endonucleasas de manera offline. Es un software desarrollado por el equipo de Mekentosj.com y se llama Enzyme X. Como ya preceden todas las aplicaciones destinadas a ciencia que hacen estos chicos (Alexander Griekspoor (Mek) y Tom Groothuis (Tosj)),recordad Papers o Lab Assistant, el interfaz está muy cuidado. Para mostrar como funciona, os dejo un video en el que simplemente cargo dos secuencias y dejo que encuentre las enzimas de restricción así como algunas de las utilidades que ofrece como referencias a las casas comerciales más importantes a nivel mundial, simulador de gel de electroforesis, el código genético aplicado a varias especies modelo, convertidor de concentraciones..etc. Incluso se tiene la posibilidad de hacer una búsqueda directamente en las bases de datos.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=n6qfpwnC8Nw[/youtube]
Ver el vídeo en Vimeo
Esto es lo que más he utilizado ya que intento encontrar diferencias entre dos individuos concretos. Lo malo no es la aplicación sino que se necesita tener secuenciado la porción del genoma que se quiera estudiar con estas endonucleasas. Hay un pero: la aplicación está sólo disponible para Mac, pero hay otras aplicaciones en otros sistemas operativos que hacen cosas parecidas, aunque no tan cuidadas. Lo mejor de todo, que es gratuíto.
Espero que haya ayudado a algún intrépido científico maquero.
Ventana de actividad en Safari
Los usuarios de Mac tenemos una pequeña ventaja al tener Safari como uno navegador web de serie y es que se termina por saber todos los escondrijos que esconde. Para acceder a ella, en el menú de la barra de herramientas de la aplicación se abre “Ventana–>Actividad” y se observa el desplegable que muestro en la imagen.
Espero que os haya servido.
Escuchando: Podcast 290 de Territorimac
RestrictionMapper version 3
Ya que he estado estas semanas volviendo al maravilloso mundo de las enzimas de restricción, voy a explicar algo sobre una aplicación web que ayuda un poco a la hora de utilizar estas tecnologías.
RestrictionMapper version 3 es simplemente una utilidad desarrollada por una casa comercializadora de enzimas de restricción, que permite configurar diversas variables para encontrar las proteínas cortantes que nos sirvan. Se introduce la secuencia que se quiera estudiar y luego se va configurando si se quiere una endonucleasa con cierto número inicial de nucleótidos como partida, si sea o no sensible a metilaciones, si se quiere restringir el estudio a un puñado de enzimas preferidas por el investigador…etc. Finalmente se debe dar un nombre de proyecto y se da a «Run». Se obtiene una página imprimible donde expone las enzimas que cortan y las que no. Muestra el número de veces que ha actuado la endonucleasa y las posiciones de corte.
Dopaje genético
La necesidad de explotar al máximo las capacidades de los deportistas no está limitada en la toma de ciertas sustancias. Desde antes del inicio de las olimpiadas de invierno en Vancouver, los organismos encargados de controlar el doping están bastante preocupados por la posibilidad de dopaje genético. Lo más usual en el doping deportivo es el consumo de sustancias del tipo hormonal o que incidan directamente en el torrente sanguíneo para mejorar el rendimiento. En medicina se han utilizado los avances en la genética para tratar la obesidad, la diabetes o enfermedades musculares. ¿Y si se pudiera canalizar ese conocimiento para hacer trampas en el deporte? Por ejemplo, los genes de la insulina como factor de crecimiento podría aumentar la masa muscular. Y las moléculas que regulan la expresión de los genes pueden hacer que los atletas más eficiente de la energía, o ayudar a crear más fibras de contracción lenta del músculo. Todos estos estudios ya han sido publicados en la revista Science.
Lo más trascendente es que se sabe que en Alemania y en China se ha estado experimentando con estas tecnologías. Se comenta que han estado en manos de los competidores. Los investigadores apuntan que estos tratamientos hasta ahora sólo ha sido capaz de producir “ratones más rápidos o más fuertes.” Ya, ya. Generando superratones. A lo mejor empiezan a invadirnos los individuos transgénicos.
Fuente: Podcast de Scientific American
Qik: vídeos en streaming para compartir
Jugando con las aplicaciones del Market de Android me tope con una que se llamaba Qik. En la descripción decía que era un servicio para publicar vídeos que se grabaran con el móvil en streaming. En tiempo real. Había que registrarse, así que un día sin más lo probé en el laboratorio. No me lo creía. Lo que se graba se puede ver en streaming y luego,si se quiere, el vídeo se puede compartir. El tiempo no me da para jugar mucho, pero ese primer vídeo de prueba os lo quería dejar para que lo veáis. Recordad que el móvil es una HTC Magic y la cámara es lo peor del dispositivo. Aquí lo dejo.
La compresión también baja la calidad del vídeo, pero por lo menos en Android la velocidad de lanzamiento de la aplicación y conexión (recordemos que hay que tener una conexión de datos, ya sea 3G o vía WIFI) es asombrosa. En un momento estaba el vídeo colgado en la nube y listo para etiquetar.
El registro sólo os pide un nombre, nombre de usuario, contraseña y correo electrónico. Después os dice que os descarguéis la aplicación para el móvil y una vez instalada y loqueado desde el teléfono, ya se puede comenzar a grabar. El streaming se puede ver directamente desde la web del perfil. En mi caso sería http://qik.com/doctorgenoma. Y no habría que hacer más. Os recomiendo tener este servicio sobre todo si se tiene un móvil con plan de datos contratado. Creo que en un futuro le sacaré partido a la idea.
Escuchando: Cabreados 130